Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM28Q13263 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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