Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 SRB8YCR081W 4284 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 DSE4YNR067C 3354 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 SRP68YPL243W 1800 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 MUS81YDR386W 1899 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 BNA4YBL098W 1383 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YOR296WYOR296W 3870 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 ERP3YDL018C 678 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 ERP6YGL002W 651 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 CPR7YJR032W 1182 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YKL162CYKL162C 1209 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YLR042CYLR042C 486 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YLR339CYLR339C 552 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 RPL20AYMR242C 519 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 PRM4YPL156C 855 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 IRC3YDR332W 2070 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 TOR1YJR066W 7413 nt2.64□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 ECM21YBL101C 3354 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 DBP7YKR024C 2229 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YDR535CYDR535C 501 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 FIP1YJR093C 984 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YKR033CYKR033C 426 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YLR400WYLR400W 474 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YML037CYML037C 1023 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 POP8YBL018C 402 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 RPS10BYMR230W 318 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 IRC14YOR135C 342 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 SSP2YOR242C 1116 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 AFT2YPL202C 1251 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 MSB2YGR014W 3921 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 WHI3YNL197C 1986 nt2.63□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YKL100CYKL100C 1764 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 AXL1YPR122W 3627 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 NSA2YER126C 786 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 SMX2YFL017W-A 234 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YGL138CYGL138C 1038 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YGR160WYGR160W 612 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YIL161WYIL161W 708 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YIL174WYIL174W 228 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.62□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 INP52YNL106C 3552 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 PET100YDR079W 336 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 FIN1YDR130C 876 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 RTT105YER104W 627 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 PNC1YGL037C 651 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 RPB9YGL070C 369 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 BRR6YGL247W 594 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 IMP3YHR148W 552 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 RPL8BYLL045C 771 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 DUG3YNL191W 1074 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YNL203CYNL203C 612 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 ATG5YPL149W 885 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 ARA1YBR149W 1035 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 PSY2YNL201C 2577 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 PSP1YDR505C 2526 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 SKT5YBL061C 2091 nt2.61□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 ADY4YLR227C 1482 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 SLP1YOR154W 1764 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YIP5YGL161C 933 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 MPC3YGR243W 441 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 MCA1YOR197W 1299 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 SWD3YBR175W 948 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 ENP2YGR145W 2124 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 DSF2YBR007C 2211 nt2.6□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 MET6YER091C 2304 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 GEA1YJR031C 4227 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 CYR1YJL005W 6081 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 VHR2YER064C 1518 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YCL019WYCL019W 5313 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YDR209CYDR209C 414 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 RNH202YDR279W 1053 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 MPS2YGL075C 1164 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 LAC1YKL008C 1257 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 DAD2YKR083C 402 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YAR069CYAR069C 294 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 INP1YMR204C 1263 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 MPD2YOL088C 834 nt2.59□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 AI2Q0055 2565 nt2.58□□□□□ -2
SNF8Q12483 NFT1YKR103W 3657 nt2.58□□□□□ -2
SNF8Q12483 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.58□□□□□ -2
SNF8Q12483 RGI2YIL057C 495 nt2.58□□□□□ -2
SNF8Q12483 MRPL38YKL170W 417 nt2.58□□□□□ -2
SNF8Q12483 MCT1YOR221C 1083 nt2.58□□□□□ -2
SNF8Q12483 RRP7YCL031C 894 nt2.58□□□□□ -2
SNF8Q12483 UTP14YML093W 2700 nt2.58□□□□□ -2
SNF8Q12483 SKO1YNL167C 1944 nt2.58□□□□□ -2
SNF8Q12483 APC5YOR249C 2058 nt2.57□□□□□ -2
SNF8Q12483 CDC55YGL190C 1581 nt2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51 ms