Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 GYL1YMR192W 2163 nt3.32□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 PKH1YDR490C 2301 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 CDC40YDR364C 1368 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YLR446WYLR446W 1302 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 DYN2YDR424C 279 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 PUG1YER185W 912 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YFR057WYFR057W 456 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 EFG1YGR271C-A 702 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YLL037WYLL037W 381 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YLR230WYLR230W 306 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 MIT1YEL007W 2001 nt3.31□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 DIA2YOR080W 2199 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 ECM11YDR446W 909 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 CWC23YGL128C 852 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YGL242CYGL242C 546 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 PET54YGR222W 882 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 RGI2YIL057C 495 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 TMA19YKL056C 504 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YBL028CYBL028C 321 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 IMP4YNL075W 873 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 GIS2YNL255C 462 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 SLM4YBR077C 489 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 TPO5YKL174C 1857 nt3.3□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 FAR1YJL157C 2493 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 SLY41YOR307C 1362 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 SRP68YPL243W 1800 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 CBS2YDR197W 1170 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 RGI1YER067W 486 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 RPS8BYER102W 603 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 OST5YGL226C-A 261 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 SUI2YJR007W 915 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 CDC8YJR057W 651 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 VMA5YKL080W 1179 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YMR087WYMR087W 855 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 DLT1YMR126C 1029 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 RPS8AYBL072C 603 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 AAR2YBL074C 1068 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YOL106WYOL106W 354 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YOR366WYOR366W 354 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 RAD2YGR258C 3096 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 RED1YLR263W 2484 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 GCD2YGR083C 1956 nt3.29□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 DSE4YNR067C 3354 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YDR491CYDR491C 492 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YEL075CYEL075C 369 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 SVP26YHR181W 687 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 RPS21AYKR057W 264 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YBL055CYBL055C 1257 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YNR062CYNR062C 984 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YOR203WYOR203W 354 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 SPT10YJL127C 1923 nt3.28□□□□□ -1.88
HSP42Q12329 YGL176CYGL176C 1665 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 CDC45YLR103C 1953 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 RAX2YLR084C 3663 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 DPP1YDR284C 870 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 COX6YHR051W 447 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 COX3Q0275 810 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 SFH1YLR321C 1281 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 RPN13YLR421C 471 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 RFC3YNL290W 1023 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 PPT2YPL148C 522 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 DIM1YPL266W 957 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 SOK1YDR006C 2706 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 Q0255Q0255 1419 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 CHA4YLR098C 1947 nt3.27□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 HTB1YDR224C 396 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 COBQ0105 1158 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 MTC3YGL226W 372 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 BRR6YGL247W 594 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 UPF3YGR072W 1164 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YLR076CYLR076C 423 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 RPL20AYMR242C 519 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 HUA2YOR284W 732 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 HUT1YPL244C 1020 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 MED1YPR070W 1701 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 ARG5,6YER069W 2592 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 AKR1YDR264C 2295 nt3.26□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YDR271CYDR271C 372 nt3.25□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 GUK1YDR454C 564 nt3.25□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 MPS2YGL075C 1164 nt3.25□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 AUS1YOR011W 4185 nt3.25□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 PSY2YNL201C 2577 nt3.24□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 ERP3YDL018C 678 nt3.24□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 MFA1YDR461W 111 nt3.24□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 ATP11YNL315C 957 nt3.24□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.24□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 MET5YJR137C 4329 nt3.24□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 VPS9YML097C 1356 nt3.24□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YGL230CYGL230C 444 nt3.23□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YGR073CYGR073C 372 nt3.23□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 YGR160WYGR160W 612 nt3.23□□□□□ -1.89
HSP42Q12329 EAP1YKL204W 1899 nt3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.2 ms