Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 YOR082CYOR082C 342 nt3.07□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 NEM1YHR004C 1341 nt3.07□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 KAR1YNL188W 1302 nt3.07□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 NUP170YBL079W 4509 nt3.07□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 FLO10YKR102W 3510 nt3.07□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 INO80YGL150C 4470 nt3.06□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 REV3YPL167C 4515 nt3.06□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 PLP1YDR183W 693 nt3.06□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 BCS1YDR375C 1371 nt3.06□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 MAK11YKL021C 1407 nt3.06□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YAR075WYAR075W 474 nt3.06□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 FIG1YBR040W 897 nt3.06□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 SST2YLR452C 2097 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 PHM6YDR281C 315 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 CGR1YGL029W 363 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 PNC1YGL037C 651 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 RPS25AYGR027C 327 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 TAM41YGR046W 1158 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 PFS1YHR185C 714 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YLR255CYLR255C 354 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 GLO1YML004C 981 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 TRM112YNR046W 408 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 IZH2YOL002C 954 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 PPT2YPL148C 522 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 PRM4YPL156C 855 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 ICS2YBR157C 768 nt3.05□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 PDR11YIL013C 4236 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YDL199CYDL199C 2064 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 SHR3YDL212W 633 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YDR340WYDR340W 303 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 PMI40YER003C 1290 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 DLS1YJL065C 504 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YJR111CYJR111C 852 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 ATP7YKL016C 525 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YLR290CYLR290C 834 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 FMP41YNL168C 780 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 IRC13YOR235W 315 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YOR277CYOR277C 309 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 SCD6YPR129W 1050 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 UBP15YMR304W 3693 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 INP53YOR109W 3324 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 MYO3YKL129C 3819 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 FRE4YNR060W 2160 nt3.04□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 RPS29BYDL061C 171 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 KXD1YGL079W 657 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 PDX1YGR193C 1233 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 ALB1YJL122W 528 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 AIM23YJL131C 1071 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 ERP1YAR002C-A 660 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 HUB1YNR032C-A 222 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 YPR078CYPR078C 1119 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 REB1YBR049C 2433 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 MIP6YHR015W 1980 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 GIS4YML006C 2325 nt3.03□□□□□ -1.92
SLM3Q12093 SIN4YNL236W 2925 nt3.03□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 SNQ2YDR011W 4506 nt3.02□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 MON1YGL124C 1935 nt3.02□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YGR190CYGR190C 366 nt3.02□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 EPT1YHR123W 1176 nt3.02□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 FYV6YNL133C 522 nt3.02□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 PKP2YGL059W 1476 nt3.02□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 HDA2YDR295C 2025 nt3.02□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 SAP1YER047C 2694 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 snR78snR78 87 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 TGL2YDR058C 981 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 RPS24AYER074W 408 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 HTD2YHR067W 843 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 PNO1YOR145C 825 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 HUL5YGL141W 2733 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 ALG8YOR067C 1734 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 GCD10YNL062C 1437 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 CDC5YMR001C 2118 nt3.01□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 FAS1YKL182W 6156 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 BAR1YIL015W 1764 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 ECO1YFR027W 846 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 TAN1YGL232W 870 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YGR114CYGR114C 390 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 TDA10YGR205W 873 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YIL024CYIL024C 570 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 PML39YML107C 1005 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 RLP7YNL002C 969 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 CPR8YNR028W 927 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 RPS10AYOR293W 318 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YBR292CYBR292C 372 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 KEL2YGR238C 2649 nt3□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 RDS2YPL133C 1341 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 GPP2YER062C 753 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YGR064WYGR064W 369 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 POG1YIL122W 1056 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 MET14YKL001C 609 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 BOS1YLR078C 735 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 PBA1YLR199C 831 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YNR062CYNR062C 984 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YPL035CYPL035C 348 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 YPL039WYPL039W 951 nt2.99□□□□□ -1.93
SLM3Q12093 STP1YDR463W 1560 nt2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 90 ms