Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 SYC1YOR179C 567 nt2.56□□□□□ -2
SYF2P53277 YPL035CYPL035C 348 nt2.56□□□□□ -2
SYF2P53277 PIN3YPR154W 648 nt2.56□□□□□ -2
SYF2P53277 MRPL27YBR282W 441 nt2.56□□□□□ -2
SYF2P53277 MNT3YIL014W 1893 nt2.56□□□□□ -2
SYF2P53277 GYL1YMR192W 2163 nt2.56□□□□□ -2
SYF2P53277 ECM29YHL030W 5607 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 RAX2YLR084C 3663 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 YDL032WYDL032W 312 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 GYP7YDL234C 2241 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 YDR535CYDR535C 501 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 YEL075CYEL075C 369 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 PRP18YGR006W 756 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 DCG1YIR030C 735 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 SNX4YJL036W 1272 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 SAM37YMR060C 984 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 KAR1YNL188W 1302 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 RSM19YNR037C 276 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 YOR062CYOR062C 807 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 PNO1YOR145C 825 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 RPL33AYPL143W 324 nt2.55□□□□□ -2
SYF2P53277 VIP1YLR410W 3441 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 ECM21YBL101C 3354 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 YNR066CYNR066C 1311 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 YDL050CYDL050C 372 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 TCA17YEL048C 459 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 ERP6YGL002W 651 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 YIP5YGL161C 933 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 EFG1YGR271C-A 702 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 GCD14YJL125C 1152 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 HYM1YKL189W 1200 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 PML39YML107C 1005 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 YNL035CYNL035C 1170 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 PFY1YOR122C 381 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 YPR078CYPR078C 1119 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 YOR296WYOR296W 3870 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 TPO5YKL174C 1857 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 AXL1YPR122W 3627 nt2.54□□□□□ -2
SYF2P53277 PKP2YGL059W 1476 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 DIA2YOR080W 2199 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 PUF6YDR496C 1971 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 MON1YGL124C 1935 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 MRPL32YCR003W 552 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 NHP10YDL002C 612 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 BMH2YDR099W 822 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 THO1YER063W 657 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 CPR7YJR032W 1182 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 FIP1YJR093C 984 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 YLL037WYLL037W 381 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 RPL8BYLL045C 771 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 ICS2YBR157C 768 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 YBR292CYBR292C 372 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 HFM1YGL251C 3564 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
SYF2P53277 AYT1YLL063C 1425 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 CYR1YJL005W 6081 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 SLP1YOR154W 1764 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 TSC11YER093C 4293 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 RRP42YDL111C 798 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 PLP1YDR183W 693 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YPR1YDR368W 939 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 VMA5YKL080W 1179 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 SED5YLR026C 1023 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YLR290CYLR290C 834 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 TRM112YNR046W 408 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 PAM1YDR251W 2493 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 MPS1YDL028C 2295 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF2P53277 KIN82YCR091W 2163 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 SMC2YFR031C 3513 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 TSC13YDL015C 933 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 BUD26YDR241W 288 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 VMA8YEL051W 771 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 SPT15YER148W 723 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YLR230WYLR230W 306 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 RCE1YMR274C 948 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 DUG3YNL191W 1074 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YJR061WYJR061W 2808 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YER138CYER138C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YER160CYER160C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YJR027WYJR027W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YML039WYML039W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF2P53277 YML045WYML045W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.3 ms