Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		2.75	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	ARI1	YGL157W	1044 nt		2.75	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	JIP3	YLR331C	378 nt		2.75	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RPS10B	YMR230W	318 nt		2.75	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YBL108W	YBL108W	306 nt		2.75	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	DBP7	YKR024C	2229 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	FKS3	YMR306W	5358 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	HFM1	YGL251C	3564 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RRP42	YDL111C	798 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RRG1	YDR065W	1098 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	HTA1	YDR225W	399 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YHR022C	YHR022C	771 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	XRN1	YGL173C	4587 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	STP2	YHR006W	1626 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	WHI3	YNL197C	1986 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	AXL1	YPR122W	3627 nt		2.74	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	BCK1	YJL095W	4437 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	TCP1	YDR212W	1680 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	AIM11	YER093C-A	414 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YIP5	YGL161C	933 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YIL174W	YIL174W	228 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YVH1	YIR026C	1095 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YJL222W-A	YJL222W-A	228 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	AIM25	YJR100C	984 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	ARC19	YKL013C	516 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	SWD2	YKL018W	990 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	UBS1	YBR165W	834 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	INP52	YNL106C	3552 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	VPS41	YDR080W	2979 nt		2.73	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	TEC1	YBR083W	1461 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	ARF1	YDL192W	546 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	DYN2	YDR424C	279 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	PNC1	YGL037C	651 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RPS25A	YGR027C	327 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YGR114C	YGR114C	390 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YHR097C	YHR097C	1101 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	TAO3	YIL129C	7131 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RNR2	YJL026W	1200 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	PAU23	YLR037C	375 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	COQ9	YLR201C	783 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RED1	YLR263W	2484 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	PSY3	YLR376C	729 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	HHF2	YNL030W	312 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	DUG3	YNL191W	1074 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YNR062C	YNR062C	984 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	SAS5	YOR213C	747 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	TUM1	YOR251C	915 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YOR387C	YOR387C	621 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	CYR1	YJL005W	6081 nt		2.72	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	VPS3	YDR495C	3036 nt		2.71	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	SPO71	YDR104C	3738 nt		2.71	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	NEW1	YPL226W	3591 nt		2.71	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	IOC3	YFR013W	2364 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YDR336W	YDR336W	945 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	ECM11	YDR446W	909 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RPL24B	YGR148C	468 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RPL14B	YHL001W	417 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YIL102C-A	YIL102C-A	228 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YKR011C	YKR011C	1062 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	SIC1	YLR079W	855 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	OST6	YML019W	999 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	UNG1	YML021C	1080 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YBL028C	YBL028C	321 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RPL23A	YBL087C	414 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	BAG7	YOR134W	1230 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	MCT1	YOR221C	1083 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	POL30	YBR088C	777 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	PHO88	YBR106W	567 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	SST2	YLR452C	2097 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	VPS9	YML097C	1356 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	ENA5	YDR038C	3276 nt		2.71	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	SPH1	YLR313C	1593 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	CCT7	YJL111W	1653 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	SMC2	YFR031C	3513 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	SLP1	YOR154W	1764 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	KAR5	YMR065W	1515 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YIL161W	YIL161W	708 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YLR257W	YLR257W	966 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	IZH4	YOL101C	939 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YOR062C	YOR062C	807 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	PIN3	YPR154W	648 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	BNA4	YBL098W	1383 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	PFF1	YBR074W	2931 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	ECM29	YHL030W	5607 nt		2.7	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RRI1	YDL216C	1323 nt		2.69	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RPO41	YFL036W	4056 nt		2.69	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.69	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RNH202	YDR279W	1053 nt		2.69	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	PRE1	YER012W	597 nt		2.69	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	MPS2	YGL075C	1164 nt		2.69	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YAP5	YIR018W	738 nt		2.69	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		2.69	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	VAM3	YOR106W	852 nt		2.69	□□□□□ -1.98

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