Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM106CQ9BVX2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms