Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 RRT13YER066W 558 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 MET14YKL001C 609 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 GSP1YLR293C 660 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YML090WYML090W 387 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 HHF2YNL030W 312 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YNR062CYNR062C 984 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YBR292CYBR292C 372 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 PDC2YDR081C 2778 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 SEC27YGL137W 2670 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 HEH2YDR458C 1992 nt2.8□□□□□ -1.96
SOP4P39543 ITC1YGL133W 3795 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 INP52YNL106C 3552 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 SRC1YML034W 2505 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 KIN3YAR018C 1308 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 CIN1YOR349W 3045 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 NKP1YDR383C 717 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 ECM11YDR446W 909 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YEL075CYEL075C 369 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YGR039WYGR039W 312 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 TDA10YGR205W 873 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 RNH203YLR154C 333 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 PML39YML107C 1005 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 RPA43YOR340C 981 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 CTP1YBR291C 900 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 MSH2YOL090W 2895 nt2.79□□□□□ -1.96
SOP4P39543 DBP7YKR024C 2229 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 DUN1YDL101C 1542 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 PET100YDR079W 336 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 PLP1YDR183W 693 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 RGI2YIL057C 495 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 ENV10YLR065C 546 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 IRC13YOR235W 315 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 YOR385WYOR385W 873 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 ERV15YBR210W 429 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 SPP382YLR424W 2127 nt2.78□□□□□ -1.96
SOP4P39543 BNA4YBL098W 1383 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 PFF1YBR074W 2931 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YCR016WYCR016W 873 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 AIM11YER093C-A 414 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 MPS2YGL075C 1164 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 MMF1YIL051C 438 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 VMA5YKL080W 1179 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 REC102YLR329W 795 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 PPT2YPL148C 522 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 CCL1YPR025C 1182 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YPR203WYPR203W 309 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 VIP1YLR410W 3441 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 FUN30YAL019W 3396 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 HFD1YMR110C 1599 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 TDA1YMR291W 1761 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 ESL1YIL151C 3357 nt2.77□□□□□ -1.97
SOP4P39543 ARF1YDL192W 546 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YGL177WYGL177W 348 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YHL005CYHL005C 393 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 PAU13YHL046C 363 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YKR011CYKR011C 1062 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YMR087WYMR087W 855 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 ECM13YBL043W 774 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 AAR2YBL074C 1068 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YNL184CYNL184C 327 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YPR027CYPR027C 834 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 POL30YBR088C 777 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 CDC20YGL116W 1833 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 PSP1YDR505C 2526 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 ARP9YMR033W 1404 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YIL169CYIL169C 2988 nt2.76□□□□□ -1.97
SOP4P39543 VPS9YML097C 1356 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 CDC5YMR001C 2118 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 RPS14AYCR031C 414 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 THO1YER063W 657 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 ALB1YJL122W 528 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 FYV6YNL133C 522 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YOR062CYOR062C 807 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YBR116CYBR116C 528 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 VPS3YDR495C 3036 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 ESL2YKR096W 3588 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 EPL1YFL024C 2499 nt2.75□□□□□ -1.97
SOP4P39543 JSN1YJR091C 3276 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 TAF2YCR042C 4224 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 DSE1YER124C 1722 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 EXO84YBR102C 2262 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 OPI6YDL096C 327 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 PNC1YGL037C 651 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 HTD2YHR067W 843 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 LSM12YHR121W 564 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YJL175WYJL175W 513 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 HYM1YKL189W 1200 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 BOS1YLR078C 735 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 NDL1YLR254C 570 nt2.74□□□□□ -1.97
SOP4P39543 YLR400WYLR400W 474 nt2.74□□□□□ -1.97
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