Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL2P13500 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL2P13500 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL2P13500 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL2P13500 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL2P13500 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL2P13500 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL2P13500 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL2P13500 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL2P13500 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL2P13500 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL2P13500 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL2P13500 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL2P13500 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms