Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00271P0C7V0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms