Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNE2O96020 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNE2O96020 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms