Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB5Q9Y5E4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB5Q9Y5E4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB5Q9Y5E4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB5Q9Y5E4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB5Q9Y5E4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB5Q9Y5E4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB5Q9Y5E4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB5Q9Y5E4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB5Q9Y5E4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms