Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 MAK21YDR060W 3078 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YDL050CYDL050C 372 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 SPT15YER148W 723 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 BRR6YGL247W 594 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YGR073CYGR073C 372 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 ARG3YJL088W 1017 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 GTT2YLL060C 702 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YNL109WYNL109W 546 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 PBP2YBR233W 1242 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 REC8YPR007C 2043 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 TFC1YBR123C 1950 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 CDH1YGL003C 1701 nt3.3□□□□□ -1.88
SEC28P40509 BCH1YMR237W 2175 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 IRC3YDR332W 2070 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 ARP9YMR033W 1404 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 MSR1YHR091C 1932 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 GIS4YML006C 2325 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 MET14YKL001C 609 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 GSP1YLR293C 660 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 ERG2YMR202W 669 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 APC5YOR249C 2058 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 PSP1YDR505C 2526 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 BEM4YPL161C 1902 nt3.29□□□□□ -1.88
SEC28P40509 TEC1YBR083W 1461 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 MNT3YIL014W 1893 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RRP5YMR229C 5190 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 GYL1YMR192W 2163 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 GLC3YEL011W 2115 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 SPP382YLR424W 2127 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YCG1YDR325W 3108 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 GLG2YJL137C 1143 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RPS21AYKR057W 264 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YLL037WYLL037W 381 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 NNT1YLR285W 786 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 TEM1YML064C 738 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YOR203WYOR203W 354 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RPA43YOR340C 981 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YTA7YGR270W 4140 nt3.28□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RPA135YPR010C 3612 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 MIT1YEL007W 2001 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YEL025CYEL025C 3567 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SLY41YOR307C 1362 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 STP2YHR006W 1626 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 TPO5YKL174C 1857 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 HFD1YMR110C 1599 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 BMS1YPL217C 3552 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 PET100YDR079W 336 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SMX2YFL017W-A 234 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YGR168CYGR168C 1131 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 ENV10YLR065C 546 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 GRX7YBR014C 612 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 CCL1YPR025C 1182 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 CMD1YBR109C 444 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YBR292CYBR292C 372 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SHQ1YIL104C 1524 nt3.27□□□□□ -1.89
SEC28P40509 MPS1YDL028C 2295 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 DRS2YAL026C 4068 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 PLP1YDR183W 693 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 RGI1YER067W 486 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 PET54YGR222W 882 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 RPL15AYLR029C 615 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 GOT1YMR292W 417 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 MET10YFR030W 3108 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 CHO2YGR157W 2610 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 CDC5YMR001C 2118 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YMR317WYMR317W 3423 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 TOM70YNL121C 1854 nt3.26□□□□□ -1.89
SEC28P40509 EXO5YBR163W 1758 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 GCN1YGL195W 8019 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 DSE1YER124C 1722 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 EFG1YGR271C-A 702 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 RPS21BYJL136C 264 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 VPS25YJR102C 609 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 STT4YLR305C 5703 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YHR080CYHR080C 4038 nt3.25□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SNT1YCR033W 3681 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 MUS81YDR386W 1899 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 GCD2YGR083C 1956 nt3.24□□□□□ -1.89
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