Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB3Q9UKI3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms