Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP005264.6-201ENST00000592801 414 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP9-2Q9BYQ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-2Q9BYQ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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