Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SIRT1Q96EB6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms