Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms