Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 KHA1YJL094C 2622 nt3.16□□□□□ -1.9
SMC4Q12267 HRD3YLR207W 2502 nt3.16□□□□□ -1.9
SMC4Q12267 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt3.16□□□□□ -1.9
SMC4Q12267 PST1YDR055W 1335 nt3.15□□□□□ -1.9
SMC4Q12267 YPL142CYPL142C 318 nt3.15□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 PEP7YDR323C 1548 nt3.15□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 RIF1YBR275C 5751 nt3.15□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 UTP15YMR093W 1542 nt3.14□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 ZDS2YML109W 2829 nt3.14□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 YDR249CYDR249C 1122 nt3.14□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 YGL159WYGL159W 1113 nt3.14□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 TTI2YJR136C 1266 nt3.14□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 RRG8YPR116W 834 nt3.14□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 DCP2YNL118C 2913 nt3.14□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 YHR177WYHR177W 1362 nt3.14□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 MLH1YMR167W 2310 nt3.14□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 JID1YPR061C 906 nt3.13□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 DEF1YKL054C 2217 nt3.13□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 IXR1YKL032C 1794 nt3.12□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 YKR078WYKR078W 1758 nt3.12□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 RTN1YDR233C 888 nt3.12□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 SSO2YMR183C 888 nt3.12□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 DGR1YNL130C-A 147 nt3.12□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 VPS27YNR006W 1869 nt3.12□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 TOM1YDR457W 9807 nt3.12□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 KRE33YNL132W 3171 nt3.12□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 TOR1YJR066W 7413 nt3.11□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 EMI1YDR512C 564 nt3.11□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 ISC10YER180C 804 nt3.11□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 RPL27AYHR010W 411 nt3.11□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 PCL7YIL050W 858 nt3.11□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 MAK21YDR060W 3078 nt3.11□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 YDL162CYDL162C 357 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 AIM19YIL087C 474 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 POL30YBR088C 777 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 BRE1YDL074C 2103 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 NDT80YHR124W 1884 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 YDR149CYDR149C 708 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 ARC19YKL013C 516 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 ECM1YAL059W 639 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 HST2YPL015C 1074 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 ISU1YPL135W 498 nt3.1□□□□□ -1.91
SMC4Q12267 RTT107YHR154W 3213 nt3.09□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 BUD2YKL092C 3315 nt3.09□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 SAE3YHR079C-A 276 nt3.09□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 YKL131WYKL131W 522 nt3.09□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 SAP185YJL098W 3177 nt3.09□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 UBP6YFR010W 1500 nt3.08□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 PUT2YHR037W 1728 nt3.08□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 FLO11YIR019C 4104 nt3.08□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 SIP3YNL257C 3690 nt3.08□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 MIF2YKL089W 1650 nt3.08□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 YIG1YPL201C 1386 nt3.08□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 SOL3YHR163W 750 nt3.08□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 MFM1YPL060W 1242 nt3.08□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 MYO4YAL029C 4416 nt3.07□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 PDS1YDR113C 1122 nt3.07□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 SPI1YER150W 447 nt3.07□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt3.07□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 YOL079WYOL079W 399 nt3.07□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 AMS1YGL156W 3252 nt3.07□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 YBR259WYBR259W 2067 nt3.06□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 RPL25YOL127W 429 nt3.06□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 PTR3YFR029W 2037 nt3.06□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 RSN1YMR266W 2862 nt3.05□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 YLR326WYLR326W 723 nt3.05□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 NUP192YJL039C 5052 nt3.05□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 REH1YLR387C 1299 nt3.04□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 SSK2YNR031C 4740 nt3.04□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 TRM3YDL112W 4311 nt3.04□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 MMS1YPR164W 4224 nt3.03□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 ETP1YHL010C 1758 nt3.03□□□□□ -1.92
SMC4Q12267 MSH4YFL003C 2637 nt3.02□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 PIP2YOR363C 2991 nt3.02□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 ALO1YML086C 1581 nt3.02□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 UBP2YOR124C 3819 nt3.02□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 ARP7YPR034W 1434 nt3.02□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 DUG3YNL191W 1074 nt3.02□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 IDH2YOR136W 1110 nt3.02□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 YCG1YDR325W 3108 nt3.01□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 JSN1YJR091C 3276 nt3.01□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 ARP5YNL059C 2268 nt3.01□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 YLR230WYLR230W 306 nt3.01□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 PZF1YPR186C 1290 nt3.01□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 CTF4YPR135W 2784 nt3□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 SRP68YPL243W 1800 nt3□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 YBR139WYBR139W 1527 nt3□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 BNI4YNL233W 2679 nt3□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 ADI1YMR009W 540 nt3□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 RPL36AYMR194W 303 nt3□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 RNA14YMR061W 2034 nt3□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 CBP1YJL209W 1965 nt2.99□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 CSF1YLR087C 8877 nt2.99□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 HRD1YOL013C 1656 nt2.99□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 YGL132WYGL132W 336 nt2.99□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 YLL044WYLL044W 447 nt2.99□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 PFY1YOR122C 381 nt2.99□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 FYV12YOR183W 390 nt2.99□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 SBE22YHR103W 2559 nt2.99□□□□□ -1.93
SMC4Q12267 YJL016WYJL016W 1686 nt2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 111.1 ms