Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPAS3Q8IXF0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 482.6 ms