Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC93Q567U6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms