Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2AQ12879 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GRIN2AQ12879 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GRIN2AQ12879 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GRIN2AQ12879 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
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