Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 GFA1YKL104C 2154 nt6.65□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 RPA14YDR156W 414 nt6.65□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 SOH1YGL127C 384 nt6.65□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 HIS6YIL020C 786 nt6.65□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YKL044WYKL044W 321 nt6.65□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 TGL3YMR313C 1929 nt6.65□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 ZUO1YGR285C 1302 nt6.65□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 HAA1YPR008W 2085 nt6.65□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 POL31YJR006W 1464 nt6.65□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 HRQ1YDR291W 3234 nt6.65□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 DAL7YIR031C 1665 nt6.65□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 BDF2YDL070W 1917 nt6.64□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 HSP12YFL014W 330 nt6.64□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 LDB18YLL049W 540 nt6.64□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 GLO1YML004C 981 nt6.64□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 RPL9BYNL067W 576 nt6.64□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 MRPL50YNR022C 420 nt6.64□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 SUS1YBR111W-A 291 nt6.64□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 VPS72YDR485C 2388 nt6.64□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 ERV1YGR029W 570 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 DBP8YHR169W 1296 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 PGM1YKL127W 1713 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 RPP0YLR340W 939 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 ICY1YMR195W 384 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 MRE11YMR224C 2079 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 IES4YOR189W 351 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 BAP2YBR068C 1830 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 NUT2YPR168W 474 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 HAL5YJL165C 2568 nt6.63□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 EFT2YDR385W 2529 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 EFT1YOR133W 2529 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 RGT2YDL138W 2292 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 SKO1YNL167C 1944 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 EXO5YBR163W 1758 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 SCW11YGL028C 1629 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 snR51snR51 107 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YEN1YER041W 2280 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 JEM1YJL073W 1938 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 GUP2YPL189W 1830 nt6.62□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 SET5YHR207C 1581 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 UTP4YDR324C 2331 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 PAL1YDR348C 1500 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 ADY2YCR010C 852 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 DPP1YDR284C 870 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YGL108CYGL108C 423 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 COA1YIL157C 594 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 AIM26YKL037W 357 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 ABF2YMR072W 552 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt6.61□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 RCK2YLR248W 1833 nt6.6□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.6□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 NTF2YER009W 378 nt6.6□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YOR385WYOR385W 873 nt6.6□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YPL039WYPL039W 951 nt6.6□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 ARB1YER036C 1833 nt6.6□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 NTE1YML059C 5040 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 BFA1YJR053W 1725 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YEL068CYEL068C 333 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 BNA6YFR047C 888 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YGL041CYGL041C 204 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YGR053CYGR053C 852 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 TDH3YGR192C 999 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 RPL19BYBL027W 570 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 YNL200CYNL200C 741 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 BIL1YOR304C-A 231 nt6.59□□□□□ -1.35
NCR1Q12200 HXT2YMR011W 1626 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 NUG1YER006W 1563 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 NDC80YIL144W 2076 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 YDR544CYDR544C 429 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 CTF8YHR191C 402 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 YJL150WYJL150W 303 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 YMR326CYMR326C 309 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 YBR032WYBR032W 303 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 MRPS16YPL013C 366 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 CST6YIL036W 1764 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 RIO1YOR119C 1455 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 IML2YJL082W 2196 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 CIR2YOR356W 1896 nt6.58□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 DFM1YDR411C 1026 nt6.57□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 API2YDR525W 330 nt6.57□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.57□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 GPI14YJR013W 1212 nt6.57□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 YML031C-AYML031C-A 336 nt6.57□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 FEX1YOR390W 1128 nt6.57□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 YHR045WYHR045W 1683 nt6.57□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 ERG4YGL012W 1422 nt6.57□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 IZH3YLR023C 1632 nt6.57□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 CSC1YLR241W 2349 nt6.56□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 RAP1YNL216W 2484 nt6.56□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 GUD1YDL238C 1470 nt6.56□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 NOP6YDL213C 678 nt6.56□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 BSC2YDR275W 708 nt6.56□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt6.56□□□□□ -1.36
NCR1Q12200 YPR059CYPR059C 387 nt6.56□□□□□ -1.36
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