Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRIP3Q6Q6R5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms