Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
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