Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms