Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXT1Q16394 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXT1Q16394 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms