Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	LSB1	YGR136W	726 nt		5.03	□□□□□ -1.6
NSE3	Q05541	AIM18	YHR198C	966 nt		5.03	□□□□□ -1.6
NSE3	Q05541	MMF1	YIL051C	438 nt		5.03	□□□□□ -1.6
NSE3	Q05541	AIM19	YIL087C	474 nt		5.03	□□□□□ -1.6
NSE3	Q05541	THI11	YJR156C	1023 nt		5.03	□□□□□ -1.6
NSE3	Q05541	POP3	YNL282W	588 nt		5.03	□□□□□ -1.6
NSE3	Q05541	PRP3	YDR473C	1410 nt		5.03	□□□□□ -1.6
NSE3	Q05541	DSN1	YIR010W	1731 nt		5.03	□□□□□ -1.6
NSE3	Q05541	PDR12	YPL058C	4536 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	CWC2	YDL209C	1020 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	AHA1	YDR214W	1053 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YGR226C	YGR226C	210 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	GPX1	YKL026C	504 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	HLJ1	YMR161W	675 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	MIC27	YNL100W	705 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	MDM12	YOL009C	816 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	HNT3	YOR258W	654 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YPR078C	YPR078C	1119 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	RPG1	YBR079C	2895 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	GSM1	YJL103C	1857 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	ELO2	YCR034W	1044 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	QRI7	YDL104C	1224 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YER076C	YER076C	909 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	MIG2	YGL209W	1149 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YGR064W	YGR064W	369 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YGR115C	YGR115C	780 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	GRX7	YBR014C	612 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	SPR2	YOR214C	711 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YPL025C	YPL025C	558 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	CTP1	YBR291C	900 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	POF1	YCL047C	777 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	PBN1	YCL052C	1251 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	PEX29	YDR479C	1665 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	AIM21	YIR003W	2040 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	MTR10	YOR160W	2919 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	GCD2	YGR083C	1956 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	GEM1	YAL048C	1989 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YPL109C	YPL109C	1974 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	FUR1	YHR128W	651 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	FOL3	YMR113W	1284 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	RPS10A	YOR293W	318 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YBR242W	YBR242W	717 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	UBP6	YFR010W	1500 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	CDC5	YMR001C	2118 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	LOS1	YKL205W	3303 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	AIP1	YMR092C	1848 nt		5	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	COP1	YDL145C	3606 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	ACK1	YDL203C	1872 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YDL094C	YDL094C	510 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	NOP6	YDL213C	678 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	FCF1	YDR339C	570 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YAR075W	YAR075W	474 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	MCT1	YOR221C	1083 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YBR238C	YBR238C	2196 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	RIA1	YNL163C	3333 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	TDA7	YNL176C	1911 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	RDH54	YBR073W	2877 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YCR085W	YCR085W	354 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	SPC19	YDR201W	498 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	SPO73	YER046W	432 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	ENP2	YGR145W	2124 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	GTR2	YGR163W	1026 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YIL024C	YIL024C	570 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	CTK2	YJL006C	972 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YLR217W	YLR217W	324 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	GLO1	YML004C	981 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	TPM1	YNL079C	600 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	RIB4	YOL143C	510 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YCL007C	YCL007C	393 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	MNR2	YKL064W	2910 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YML020W	YML020W	1995 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	SSL1	YLR005W	1386 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YDR029W	YDR029W	315 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YDR203W	YDR203W	318 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YDR491C	YDR491C	492 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YGL109W	YGL109W	324 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	MPC3	YGR243W	441 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YHI9	YHR029C	885 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	IGO2	YHR132W-A	396 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	PET130	YJL023C	1044 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YBR063C	YBR063C	1215 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	YGR266W	YGR266W	2106 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NSE3	Q05541	FAA1	YOR317W	2103 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	ATC1	YDR184C	885 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	MAK16	YAL025C	921 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	OAR1	YKL055C	837 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YAR061W	YAR061W	204 nt		4.96	□□□□□ -1.62

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