Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms