Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NOP58Q9Y2X3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOP58Q9Y2X3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms