Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAPLN3Q96S86 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms