Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CUL4AQ13619 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4AQ13619 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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