Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABARAPO95166 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.6 ms