Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARID3CA6NKF2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms