Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms