Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms