Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX3Q13761 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX3Q13761 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX3Q13761 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms