Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YJR146WYJR146W 354 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YKR047WYKR047W 306 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 NGR1YBR212W 2019 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 SEC23YPR181C 2307 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YBR241CYBR241C 1467 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 VPS9YML097C 1356 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 BCP1YDR361C 852 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 HHY1YEL059W 309 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YLR302CYLR302C 363 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YNL019CYNL019C 855 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YNL033WYNL033W 855 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YNR014WYNR014W 639 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YMR155WYMR155W 1644 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 VMS1YDR049W 1899 nt7□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 TAH11YJR046W 1815 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 MRPL11YDL202W 750 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 SDH4YDR178W 546 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 CSN9YDR179C 489 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 ATP5YDR298C 639 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YFL032WYFL032W 321 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 BCY1YIL033C 1251 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 OAR1YKL055C 837 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YMR130WYMR130W 909 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 ATG5YPL149W 885 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 GRE1YPL223C 507 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 ARP9YMR033W 1404 nt6.99□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 PMT3YOR321W 2262 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 snR5snR5 204 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 SLO1YER180C-A 258 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 PAC10YGR078C 600 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 VMA22YHR060W 546 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 BNA1YJR025C 534 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 UIP3YAR027W 708 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 AIM39YOL053W 1188 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YOR131CYOR131C 657 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YPR123CYPR123C 435 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 RLF2YPR018W 1821 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 RTC5YOR118W 1704 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 HCA4YJL033W 2313 nt6.98□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 STE5YDR103W 2754 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 BRE2YLR015W 1518 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 SMC5YOL034W 3282 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 ARF2YDL137W 546 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 RRP4YHR069C 1080 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 RPA34YJL148W 702 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 RPL17AYKL180W 555 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YLR031WYLR031W 561 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 ARL1YBR164C 552 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 HSM3YBR272C 1443 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 snR54snR54 86 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 GNT1YOR320C 1476 nt6.97□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 APE1YKL103C 1545 nt6.96□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 MEC3YLR288C 1425 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 AGP2YBR132C 1791 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YGR017WYGR017W 894 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 FMP48YGR052W 1110 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 SYN8YAL014C 768 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 RHO4YKR055W 876 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 PDP3YLR455W 915 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 RLP7YNL002C 969 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 ECM7YLR443W 1347 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 STE7YDL159W 1548 nt6.96□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 RQC1YDR333C 2172 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YDL187CYDL187C 330 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 GUK1YDR454C 564 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 RNR4YGR180C 1038 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 APQ12YIL040W 417 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 ATG36YJL185C 882 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 CSE4YKL049C 690 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 TOS6YNL300W 309 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 RAD28YDR030C 1521 nt6.95□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 EDE1YBL047C 4146 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YIP1YGR172C 747 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 APS3YJL024C 585 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 RPL39YJL189W 156 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YJR038CYJR038C 363 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 COQ3YOL096C 939 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 RPS28AYOR167C 204 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 OPI11YPR044C 354 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 TFC6YDR362C 2019 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 XKS1YGR194C 1803 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 ACF2YLR144C 2340 nt6.94□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 CYB2YML054C 1776 nt6.93□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 MET3YJR010W 1536 nt6.93□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YFL063WYFL063W 456 nt6.93□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.93□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.93□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 AFR1YDR085C 1863 nt6.93□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YLL066CYLL066C 3618 nt6.93□□□□□ -1.3
NCR1Q12200 YLL067CYLL067C 3618 nt6.93□□□□□ -1.3
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