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Protein–RNA interactions for Protein: P53829
CAF40, Protein CAF40, yeast
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373 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
CAF40
P53829
RRN9
YMR270C
1098 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
EOS1
YNL080C
1101 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
IST1
YNL265C
897 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YNL320W
YNL320W
855 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
IPP1
YBR011C
864 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
SYC1
YOR179C
567 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YBR116C
YBR116C
528 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
MTC4
YBR255W
2085 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
APE2
YKL157W
2859 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
SEG1
YMR086W
2883 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
MAG2
YLR427W
2013 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YVC1
YOR087W
2028 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
SIP1
YDR422C
2448 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
PLM2
YDR501W
1566 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
LAS1
YKR063C
1509 nt
3.54
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
AGA1
YNR044W
2178 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
RNT1
YMR239C
1416 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
AIM14
YGL160W
1713 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
BUD6
YLR319C
2367 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
URC2
YDR520C
2319 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
COM2
YER130C
1332 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
NEM1
YHR004C
1341 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
MIC60
YKR016W
1623 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YDR464C-A
YDR464C-A
189 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YER145C-A
YER145C-A
438 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
RPL22B
YFL034C-A
369 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YFL064C
YFL064C
525 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
SPT4
YGR063C
309 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YHR173C
YHR173C
339 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
PFS1
YHR185C
714 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
FMC1
YIL098C
468 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
PSF2
YJL072C
642 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
FIP1
YJR093C
984 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YLR154W-B
YLR154W-B
165 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
LIP2
YLR239C
987 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YLR339C
YLR339C
552 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
MRPL39
YML009C
213 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YNL303W
YNL303W
348 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
PSF3
YOL146W
585 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
RRP36
YOR287C
903 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
TYE7
YOR344C
876 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
GRX5
YPL059W
453 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
FRM2
YCL026C-A
582 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
YHR202W
YHR202W
1809 nt
3.53
□□□□□ -1.84
CAF40
P53829
JHD2
YJR119C
2187 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
MNN4
YKL201C
3537 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
PRP22
YER013W
3438 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
OCA4
YCR095C
1089 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YDR535C
YDR535C
501 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
MEI4
YER044C-A
1227 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YOS1
YER074W-A
258 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YER076C
YER076C
909 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YFL012W
YFL012W
447 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YGL204C
YGL204C
306 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
GTF1
YGR102C
552 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YHL026C
YHL026C
948 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
ERG20
YJL167W
1059 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YJR096W
YJR096W
849 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
AUR1
YKL004W
1206 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
LDB18
YLL049W
540 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
SRT1
YMR101C
1032 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
MED11
YMR112C
396 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
HSH49
YOR319W
642 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
snR189
snR189
189 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
AIM21
YIR003W
2040 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
DIT2
YDR402C
1470 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
ACA1
YER045C
1470 nt
3.52
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YLR352W
YLR352W
2424 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
TAF8
YML114C
1533 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YDL027C
YDL027C
1263 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
SNU23
YDL098C
585 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YIL156W-A
YIL156W-A
402 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
BNA1
YJR025C
534 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
PAM18
YLR008C
507 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YML053C
YML053C
639 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
DUG3
YNL191W
1074 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
ELA1
YNL230C
1140 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
COS1
YNL336W
1146 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
RPS19A
YOL121C
435 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
SCD6
YPR129W
1050 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
ACE2
YLR131C
2313 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
PUB1
YNL016W
1362 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
SPT14
YPL175W
1359 nt
3.51
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YIL001W
YIL001W
1542 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
GCN5
YGR252W
1320 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
MET17
YLR303W
1335 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
RPC11
YDR045C
333 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
CWC23
YGL128C
852 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
VMA7
YGR020C
357 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
RPB3
YIL021W
957 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
RSM25
YIL093C
795 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YLR407W
YLR407W
687 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
CSM3
YMR048W
954 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YMR099C
YMR099C
894 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
OSW1
YOR255W
837 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YOR263C
YOR263C
408 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
YPR027C
YPR027C
834 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
RTS1
YOR014W
2274 nt
3.5
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
RXT3
YDL076C
885 nt
3.49
□□□□□ -1.85
CAF40
P53829
IZH1
YDR492W
951 nt
3.49
□□□□□ -1.85
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