Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00271P0C7V0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms