Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 RET2YFR051C 1641 nt9.13□□□□□ -0.95
SFG1Q12507 INA1YLR413W 2028 nt9.12□□□□□ -0.95
SFG1Q12507 ALD4YOR374W 1560 nt9.12□□□□□ -0.95
SFG1Q12507 YDR010CYDR010C 333 nt9.11□□□□□ -0.95
SFG1Q12507 PLB1YMR008C 1995 nt9.11□□□□□ -0.95
SFG1Q12507 SPT20YOL148C 1815 nt9.1□□□□□ -0.95
SFG1Q12507 YCR102CYCR102C 1107 nt9.1□□□□□ -0.95
SFG1Q12507 GLR1YPL091W 1452 nt9.09□□□□□ -0.95
SFG1Q12507 HIF1YLL022C 1158 nt9.09□□□□□ -0.95
SFG1Q12507 PHO89YBR296C 1725 nt9.08□□□□□ -0.96
SFG1Q12507 ARP6YLR085C 1317 nt9.07□□□□□ -0.96
SFG1Q12507 PRM5YIL117C 957 nt9.07□□□□□ -0.96
SFG1Q12507 MRP20YDR405W 792 nt9.05□□□□□ -0.96
SFG1Q12507 NBP35YGL091C 987 nt9.05□□□□□ -0.96
SFG1Q12507 XYL2YLR070C 1071 nt9.05□□□□□ -0.96
SFG1Q12507 AIM45YPR004C 1035 nt9.05□□□□□ -0.96
SFG1Q12507 YMR244WYMR244W 1068 nt9.04□□□□□ -0.96
SFG1Q12507 SAM35YHR083W 990 nt9.02□□□□□ -0.97
SFG1Q12507 RBG1YAL036C 1110 nt9.01□□□□□ -0.97
SFG1Q12507 RPC82YPR190C 1965 nt8.99□□□□□ -0.97
SFG1Q12507 YMR226CYMR226C 804 nt8.97□□□□□ -0.97
SFG1Q12507 CLB6YGR109C 1143 nt8.96□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 TIR3YIL011W 810 nt8.96□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 ZRT3YKL175W 1512 nt8.95□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 UTR1YJR049C 1593 nt8.95□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 HSL7YBR133C 2484 nt8.95□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 RPL4BYDR012W 1089 nt8.94□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 RPL4AYBR031W 1089 nt8.94□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 COQ2YNR041C 1119 nt8.93□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 RBG2YGR173W 1107 nt8.92□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 LSC2YGR244C 1284 nt8.92□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.92□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 GAP1YKR039W 1809 nt8.91□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 SFA1YDL168W 1161 nt8.91□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 YML089CYML089C 369 nt8.9□□□□□ -0.98
SFG1Q12507 UTH1YKR042W 1098 nt8.88□□□□□ -0.99
SFG1Q12507 BSP1YPR171W 1731 nt8.88□□□□□ -0.99
SFG1Q12507 YLR111WYLR111W 333 nt8.87□□□□□ -0.99
SFG1Q12507 RIM8YGL045W 1629 nt8.83□□□□□ -1
SFG1Q12507 PRO1YDR300C 1287 nt8.83□□□□□ -1
SFG1Q12507 SSN3YPL042C 1668 nt8.82□□□□□ -1
SFG1Q12507 RPS14BYJL191W 417 nt8.82□□□□□ -1
SFG1Q12507 POM34YLR018C 900 nt8.82□□□□□ -1
SFG1Q12507 SDH5YOL071W 489 nt8.82□□□□□ -1
SFG1Q12507 YJL067WYJL067W 351 nt8.81□□□□□ -1
SFG1Q12507 ATG15YCR068W 1563 nt8.81□□□□□ -1
SFG1Q12507 RAD23YEL037C 1197 nt8.8□□□□□ -1
SFG1Q12507 TSC10YBR265W 963 nt8.8□□□□□ -1
SFG1Q12507 HXT1YHR094C 1713 nt8.8□□□□□ -1
SFG1Q12507 SHH4YLR164W 507 nt8.79□□□□□ -1
SFG1Q12507 TOM6YOR045W 186 nt8.79□□□□□ -1
SFG1Q12507 HIP1YGR191W 1812 nt8.79□□□□□ -1
SFG1Q12507 HEL2YDR266C 1920 nt8.78□□□□□ -1
SFG1Q12507 MUP1YGR055W 1725 nt8.78□□□□□ -1
SFG1Q12507 MET28YIR017C 564 nt8.78□□□□□ -1
SFG1Q12507 NRT1YOR071C 1797 nt8.78□□□□□ -1
SFG1Q12507 FIT3YOR383C 615 nt8.76□□□□□ -1.01
SFG1Q12507 YGL114WYGL114W 2178 nt8.75□□□□□ -1.01
SFG1Q12507 PEX2YJL210W 816 nt8.74□□□□□ -1.01
SFG1Q12507 YNL024CYNL024C 741 nt8.74□□□□□ -1.01
SFG1Q12507 DIF1YLR437C 402 nt8.73□□□□□ -1.01
SFG1Q12507 TIF6YPR016C 738 nt8.72□□□□□ -1.01
SFG1Q12507 DBP1YPL119C 1854 nt8.71□□□□□ -1.01
SFG1Q12507 ILV3YJR016C 1758 nt8.71□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 HOL1YNR055C 1761 nt8.71□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 SHY1YGR112W 1170 nt8.7□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 SAM1YLR180W 1149 nt8.7□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 YGR012WYGR012W 1182 nt8.69□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.69□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.68□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.68□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 CWC15YDR163W 528 nt8.66□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 RIB3YDR487C 627 nt8.66□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 LIP1YMR298W 453 nt8.66□□□□□ -1.02
SFG1Q12507 SED1YDR077W 1017 nt8.63□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 HIS2YFR025C 1008 nt8.63□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 YOR325WYOR325W 474 nt8.63□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 URA6YKL024C 615 nt8.61□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 YAR028WYAR028W 705 nt8.61□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 YLR279WYLR279W 390 nt8.61□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.61□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 YBL086CYBL086C 1401 nt8.61□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 OPI10YOL032W 741 nt8.6□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.6□□□□□ -1.03
SFG1Q12507 ALP1YNL270C 1722 nt8.58□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 COQ8YGL119W 1506 nt8.57□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 CCT2YIL142W 1584 nt8.56□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 TOA2YKL058W 369 nt8.55□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 MAE1YKL029C 2010 nt8.54□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 YMR209CYMR209C 1374 nt8.54□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 PET8YNL003C 855 nt8.54□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 MSB4YOL112W 1479 nt8.53□□□□□ -1.04
SFG1Q12507 YPI1YFR003C 468 nt8.52□□□□□ -1.05
SFG1Q12507 OYE3YPL171C 1203 nt8.52□□□□□ -1.05
SFG1Q12507 ARO8YGL202W 1503 nt8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.6 ms