Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 SBA1YKL117W 651 nt8.96□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 GOR1YNL274C 1053 nt8.96□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 SWC5YBR231C 912 nt8.96□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 YMR209CYMR209C 1374 nt8.94□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 ZRT3YKL175W 1512 nt8.94□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 PRM5YIL117C 957 nt8.93□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 NAT4YMR069W 858 nt8.93□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 ALG3YBL082C 1377 nt8.93□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 URA8YJR103W 1737 nt8.91□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 AVT6YER119C 1347 nt8.91□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 VPS75YNL246W 795 nt8.9□□□□□ -0.98
RTR2Q12378 PLB1YMR008C 1995 nt8.9□□□□□ -0.99
RTR2Q12378 YNL024CYNL024C 741 nt8.88□□□□□ -0.99
RTR2Q12378 ESBP6YNL125C 2022 nt8.88□□□□□ -0.99
RTR2Q12378 HIS2YFR025C 1008 nt8.86□□□□□ -0.99
RTR2Q12378 MIR1YJR077C 936 nt8.85□□□□□ -0.99
RTR2Q12378 ILV3YJR016C 1758 nt8.84□□□□□ -0.99
RTR2Q12378 ILV2YMR108W 2064 nt8.84□□□□□ -0.99
RTR2Q12378 MSF1YPR047W 1410 nt8.84□□□□□ -0.99
RTR2Q12378 THI74YDR438W 1113 nt8.83□□□□□ -1
RTR2Q12378 YJL067WYJL067W 351 nt8.82□□□□□ -1
RTR2Q12378 YHL008CYHL008C 1884 nt8.82□□□□□ -1
RTR2Q12378 GTB1YDR221W 2109 nt8.8□□□□□ -1
RTR2Q12378 ARP6YLR085C 1317 nt8.79□□□□□ -1
RTR2Q12378 TIM17YJL143W 477 nt8.78□□□□□ -1
RTR2Q12378 UGP1YKL035W 1500 nt8.77□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 PSD1YNL169C 1503 nt8.77□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 COQ8YGL119W 1506 nt8.76□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 YOR325WYOR325W 474 nt8.76□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 PAU7YAR020C 168 nt8.75□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 CYT1YOR065W 930 nt8.74□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 SAM35YHR083W 990 nt8.73□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 DAT1YML113W 747 nt8.73□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 DTR1YBR180W 1719 nt8.73□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 SHM2YLR058C 1410 nt8.72□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 THI72YOR192C 1800 nt8.72□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 UTR1YJR049C 1593 nt8.72□□□□□ -1.01
RTR2Q12378 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.71□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 GAL2YLR081W 1725 nt8.71□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 HXK1YFR053C 1458 nt8.7□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 UBA4YHR111W 1323 nt8.69□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 YGL034CYGL034C 366 nt8.67□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 ARO8YGL202W 1503 nt8.67□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 SHB17YKR043C 816 nt8.67□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 NBP35YGL091C 987 nt8.66□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 NIT1YIL164C 600 nt8.66□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 ALD5YER073W 1563 nt8.65□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 OPI10YOL032W 741 nt8.65□□□□□ -1.02
RTR2Q12378 YMR244WYMR244W 1068 nt8.64□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 SGT2YOR007C 1041 nt8.64□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 DMA2YNL116W 1569 nt8.64□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 SGA1YIL099W 1650 nt8.63□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 KES1YPL145C 1305 nt8.63□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 YSR3YKR053C 1215 nt8.63□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 RFC1YOR217W 2586 nt8.63□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 YDR010CYDR010C 333 nt8.62□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 FRE6YLL051C 2139 nt8.61□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 GLR1YPL091W 1452 nt8.61□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 RSC8YFR037C 1674 nt8.59□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 CCT2YIL142W 1584 nt8.59□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 BSP1YPR171W 1731 nt8.59□□□□□ -1.03
RTR2Q12378 TOK1YJL093C 2076 nt8.58□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 BET2YPR176C 978 nt8.58□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 RET2YFR051C 1641 nt8.58□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 YCR102CYCR102C 1107 nt8.57□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 XYL2YLR070C 1071 nt8.57□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 YCR087WYCR087W 516 nt8.56□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 GAP1YKR039W 1809 nt8.56□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 HXT1YHR094C 1713 nt8.55□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 PHO89YBR296C 1725 nt8.54□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 CWC15YDR163W 528 nt8.54□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 SHY1YGR112W 1170 nt8.54□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 DBP1YPL119C 1854 nt8.53□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 RBG1YAL036C 1110 nt8.53□□□□□ -1.04
RTR2Q12378 YOR072WYOR072W 315 nt8.52□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 YHR218WYHR218W 1812 nt8.52□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 ZAP1YJL056C 2643 nt8.51□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 AIM45YPR004C 1035 nt8.5□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 NRT1YOR071C 1797 nt8.49□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 PCP1YGR101W 1041 nt8.49□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 LSB6YJL100W 1824 nt8.48□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 RBG2YGR173W 1107 nt8.48□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 LSC2YGR244C 1284 nt8.48□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 MEP3YPR138C 1470 nt8.48□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 MRP20YDR405W 792 nt8.47□□□□□ -1.05
RTR2Q12378 ODC1YPL134C 933 nt8.46□□□□□ -1.06
RTR2Q12378 COQ2YNR041C 1119 nt8.44□□□□□ -1.06
RTR2Q12378 YMR226CYMR226C 804 nt8.43□□□□□ -1.06
RTR2Q12378 SFA1YDL168W 1161 nt8.42□□□□□ -1.06
RTR2Q12378 URA6YKL024C 615 nt8.41□□□□□ -1.06
RTR2Q12378 QDR2YIL121W 1629 nt8.4□□□□□ -1.06
RTR2Q12378 MTO1YGL236C 2010 nt8.4□□□□□ -1.06
RTR2Q12378 TIR3YIL011W 810 nt8.39□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.38□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 MEX67YPL169C 1800 nt8.38□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 PRO1YDR300C 1287 nt8.37□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 RPL4BYDR012W 1089 nt8.36□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 RPL4AYBR031W 1089 nt8.36□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 YRF1-2YER190W 5046 nt8.36□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 DIF1YLR437C 402 nt8.35□□□□□ -1.07
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