Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 SPT20YOL148C 1815 nt10.05□□□□□ -0.8
YLL054CQ12244 IRC24YIR036C 792 nt10.04□□□□□ -0.8
YLL054CQ12244 DUS1YML080W 1272 nt10.04□□□□□ -0.8
YLL054CQ12244 YCL074WYCL074W 927 nt10.03□□□□□ -0.8
YLL054CQ12244 AVT6YER119C 1347 nt10.03□□□□□ -0.8
YLL054CQ12244 YFL066CYFL066C 1179 nt10.02□□□□□ -0.81
YLL054CQ12244 GOR1YNL274C 1053 nt10.02□□□□□ -0.81
YLL054CQ12244 TOK1YJL093C 2076 nt10.02□□□□□ -0.81
YLL054CQ12244 THI72YOR192C 1800 nt10.01□□□□□ -0.81
YLL054CQ12244 RRT5YFR032C 870 nt10.01□□□□□ -0.81
YLL054CQ12244 VPS75YNL246W 795 nt10.01□□□□□ -0.81
YLL054CQ12244 CLB6YGR109C 1143 nt9.97□□□□□ -0.81
YLL054CQ12244 PRE6YOL038W 765 nt9.97□□□□□ -0.81
YLL054CQ12244 REG2YBR050C 1017 nt9.94□□□□□ -0.82
YLL054CQ12244 NIT1YIL164C 600 nt9.92□□□□□ -0.82
YLL054CQ12244 SGT2YOR007C 1041 nt9.92□□□□□ -0.82
YLL054CQ12244 DUT1YBR252W 444 nt9.92□□□□□ -0.82
YLL054CQ12244 PAU16YKL224C 372 nt9.91□□□□□ -0.82
YLL054CQ12244 PAU7YAR020C 168 nt9.91□□□□□ -0.82
YLL054CQ12244 DAT1YML113W 747 nt9.9□□□□□ -0.82
YLL054CQ12244 PAM17YKR065C 594 nt9.89□□□□□ -0.83
YLL054CQ12244 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.88□□□□□ -0.83
YLL054CQ12244 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.88□□□□□ -0.83
YLL054CQ12244 STR3YGL184C 1398 nt9.86□□□□□ -0.83
YLL054CQ12244 YCR102CYCR102C 1107 nt9.85□□□□□ -0.83
YLL054CQ12244 AQY2YLL052C 450 nt9.85□□□□□ -0.83
YLL054CQ12244 HEM14YER014W 1620 nt9.83□□□□□ -0.84
YLL054CQ12244 MUP1YGR055W 1725 nt9.83□□□□□ -0.84
YLL054CQ12244 NRT1YOR071C 1797 nt9.82□□□□□ -0.84
YLL054CQ12244 MIR1YJR077C 936 nt9.79□□□□□ -0.84
YLL054CQ12244 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.78□□□□□ -0.84
YLL054CQ12244 NAT4YMR069W 858 nt9.77□□□□□ -0.85
YLL054CQ12244 THI74YDR438W 1113 nt9.75□□□□□ -0.85
YLL054CQ12244 SHB17YKR043C 816 nt9.75□□□□□ -0.85
YLL054CQ12244 RTN2YDL204W 1182 nt9.74□□□□□ -0.85
YLL054CQ12244 NBP35YGL091C 987 nt9.74□□□□□ -0.85
YLL054CQ12244 YHL008CYHL008C 1884 nt9.74□□□□□ -0.85
YLL054CQ12244 RPC82YPR190C 1965 nt9.74□□□□□ -0.85
YLL054CQ12244 YDR010CYDR010C 333 nt9.71□□□□□ -0.86
YLL054CQ12244 UBA4YHR111W 1323 nt9.7□□□□□ -0.86
YLL054CQ12244 HXK1YFR053C 1458 nt9.69□□□□□ -0.86
YLL054CQ12244 MSF1YPR047W 1410 nt9.68□□□□□ -0.86
YLL054CQ12244 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.68□□□□□ -0.86
YLL054CQ12244 RET2YFR051C 1641 nt9.67□□□□□ -0.86
YLL054CQ12244 TIR3YIL011W 810 nt9.67□□□□□ -0.86
YLL054CQ12244 YSR3YKR053C 1215 nt9.66□□□□□ -0.86
YLL054CQ12244 ARA2YMR041C 1008 nt9.66□□□□□ -0.86
YLL054CQ12244 INA1YLR413W 2028 nt9.65□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 PHO89YBR296C 1725 nt9.64□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 LSC2YGR244C 1284 nt9.63□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 FRA1YLL029W 2250 nt9.63□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 ARP6YLR085C 1317 nt9.62□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 MTO1YGL236C 2010 nt9.62□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 YCR087WYCR087W 516 nt9.62□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 ALD5YER073W 1563 nt9.62□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.6□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 YLR122CYLR122C 378 nt9.59□□□□□ -0.87
YLL054CQ12244 PLB1YMR008C 1995 nt9.58□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 SFA1YDL168W 1161 nt9.57□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 SHH4YLR164W 507 nt9.57□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 ABZ2YMR289W 1125 nt9.57□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 YMR209CYMR209C 1374 nt9.57□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 MRP20YDR405W 792 nt9.56□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 YGL034CYGL034C 366 nt9.56□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 HIF1YLL022C 1158 nt9.56□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 YML089CYML089C 369 nt9.56□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 PRO1YDR300C 1287 nt9.55□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 BUR6YER159C 429 nt9.55□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 POM34YLR018C 900 nt9.55□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 XYL2YLR070C 1071 nt9.54□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 ILV3YJR016C 1758 nt9.53□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 GAP1YKR039W 1809 nt9.53□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 ATG15YCR068W 1563 nt9.53□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 HOL1YNR055C 1761 nt9.52□□□□□ -0.88
YLL054CQ12244 TPN1YGL186C 1740 nt9.51□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 PRM5YIL117C 957 nt9.51□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 COQ2YNR041C 1119 nt9.5□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 TOM6YOR045W 186 nt9.5□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 AIM45YPR004C 1035 nt9.5□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 ALD4YOR374W 1560 nt9.5□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 RSC4YKR008W 1878 nt9.49□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 YJR154WYJR154W 1041 nt9.49□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 TOM71YHR117W 1920 nt9.48□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 Q0010Q0010 387 nt9.48□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 MEP3YPR138C 1470 nt9.47□□□□□ -0.89
YLL054CQ12244 LCP5YER127W 1074 nt9.45□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 SAM35YHR083W 990 nt9.45□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 PEX2YJL210W 816 nt9.45□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 RBG1YAL036C 1110 nt9.45□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 RPL4BYDR012W 1089 nt9.44□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 RPL4AYBR031W 1089 nt9.44□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 UTR1YJR049C 1593 nt9.44□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 UTH1YKR042W 1098 nt9.42□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 HIP1YGR191W 1812 nt9.42□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 TIF6YPR016C 738 nt9.41□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 NSG2YNL156C 900 nt9.4□□□□□ -0.9
YLL054CQ12244 MET28YIR017C 564 nt9.39□□□□□ -0.91
YLL054CQ12244 ALR1YOL130W 2580 nt9.38□□□□□ -0.91
YLL054CQ12244 SFL1YOR140W 2301 nt9.37□□□□□ -0.91
YLL054CQ12244 PSD1YNL169C 1503 nt9.36□□□□□ -0.91
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