Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 YCL074WYCL074W 927 nt10.01□□□□□ -0.81
RPN8Q08723 NIT1YIL164C 600 nt10.01□□□□□ -0.81
RPN8Q08723 MRP20YDR405W 792 nt9.99□□□□□ -0.81
RPN8Q08723 HHO1YPL127C 777 nt9.95□□□□□ -0.82
RPN8Q08723 SAM1YLR180W 1149 nt9.93□□□□□ -0.82
RPN8Q08723 YLR111WYLR111W 333 nt9.92□□□□□ -0.82
RPN8Q08723 DUS1YML080W 1272 nt9.92□□□□□ -0.82
RPN8Q08723 HEL2YDR266C 1920 nt9.92□□□□□ -0.82
RPN8Q08723 YCR102CYCR102C 1107 nt9.89□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 GOR1YNL274C 1053 nt9.89□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 CLB6YGR109C 1143 nt9.88□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.88□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.88□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 AVT6YER119C 1347 nt9.87□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 RPL4BYDR012W 1089 nt9.87□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 RPL4AYBR031W 1089 nt9.87□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 SPT20YOL148C 1815 nt9.86□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 COQ2YNR041C 1119 nt9.84□□□□□ -0.83
RPN8Q08723 RAD23YEL037C 1197 nt9.81□□□□□ -0.84
RPN8Q08723 RPC82YPR190C 1965 nt9.8□□□□□ -0.84
RPN8Q08723 STR3YGL184C 1398 nt9.79□□□□□ -0.84
RPN8Q08723 SDH5YOL071W 489 nt9.78□□□□□ -0.84
RPN8Q08723 UTH1YKR042W 1098 nt9.76□□□□□ -0.85
RPN8Q08723 SFA1YDL168W 1161 nt9.75□□□□□ -0.85
RPN8Q08723 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.75□□□□□ -0.85
RPN8Q08723 RPS14BYJL191W 417 nt9.73□□□□□ -0.85
RPN8Q08723 TIR3YIL011W 810 nt9.72□□□□□ -0.85
RPN8Q08723 DUT1YBR252W 444 nt9.72□□□□□ -0.85
RPN8Q08723 TSC10YBR265W 963 nt9.72□□□□□ -0.85
RPN8Q08723 RIM8YGL045W 1629 nt9.71□□□□□ -0.85
RPN8Q08723 YML089CYML089C 369 nt9.7□□□□□ -0.86
RPN8Q08723 INA1YLR413W 2028 nt9.68□□□□□ -0.86
RPN8Q08723 YGL114WYGL114W 2178 nt9.66□□□□□ -0.86
RPN8Q08723 LSC2YGR244C 1284 nt9.65□□□□□ -0.86
RPN8Q08723 RIB3YDR487C 627 nt9.64□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 NBP35YGL091C 987 nt9.64□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 RTN2YDL204W 1182 nt9.63□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.63□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 MUP1YGR055W 1725 nt9.62□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 HIP1YGR191W 1812 nt9.62□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 YGR012WYGR012W 1182 nt9.62□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 NRT1YOR071C 1797 nt9.62□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 STE4YOR212W 1272 nt9.61□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 MET28YIR017C 564 nt9.6□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 HIF1YLL022C 1158 nt9.6□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 AQY2YLL052C 450 nt9.6□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 POM34YLR018C 900 nt9.59□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 FIT3YOR383C 615 nt9.59□□□□□ -0.87
RPN8Q08723 MAE1YKL029C 2010 nt9.58□□□□□ -0.88
RPN8Q08723 TOM6YOR045W 186 nt9.57□□□□□ -0.88
RPN8Q08723 FUN14YAL008W 597 nt9.56□□□□□ -0.88
RPN8Q08723 PEX2YJL210W 816 nt9.54□□□□□ -0.88
RPN8Q08723 SHH4YLR164W 507 nt9.54□□□□□ -0.88
RPN8Q08723 HOL1YNR055C 1761 nt9.53□□□□□ -0.88
RPN8Q08723 YLR349WYLR349W 507 nt9.53□□□□□ -0.88
RPN8Q08723 RAD51YER095W 1203 nt9.51□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.51□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 YPI1YFR003C 468 nt9.5□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 YJL195CYJL195C 702 nt9.5□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 YNR029CYNR029C 1290 nt9.5□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 TIF6YPR016C 738 nt9.5□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 ATG15YCR068W 1563 nt9.5□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 YLR279WYLR279W 390 nt9.49□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 ADH7YCR105W 1086 nt9.48□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 PRO1YDR300C 1287 nt9.48□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 PRM5YIL117C 957 nt9.48□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 ALD4YOR374W 1560 nt9.48□□□□□ -0.89
RPN8Q08723 PLB1YMR008C 1995 nt9.45□□□□□ -0.9
RPN8Q08723 SFP1YLR403W 2052 nt9.44□□□□□ -0.9
RPN8Q08723 ARP6YLR085C 1317 nt9.43□□□□□ -0.9
RPN8Q08723 PAU15YIR041W 375 nt9.43□□□□□ -0.9
RPN8Q08723 ADH1YOL086C 1047 nt9.43□□□□□ -0.9
RPN8Q08723 ACO2YJL200C 2370 nt9.42□□□□□ -0.9
RPN8Q08723 CAB5YDR196C 726 nt9.4□□□□□ -0.9
RPN8Q08723 YEL008WYEL008W 381 nt9.4□□□□□ -0.9
RPN8Q08723 MET2YNL277W 1461 nt9.4□□□□□ -0.91
RPN8Q08723 MSB4YOL112W 1479 nt9.4□□□□□ -0.91
RPN8Q08723 GND1YHR183W 1470 nt9.39□□□□□ -0.91
RPN8Q08723 GAP1YKR039W 1809 nt9.38□□□□□ -0.91
RPN8Q08723 LOT5YKL183W 921 nt9.36□□□□□ -0.91
RPN8Q08723 SSN3YPL042C 1668 nt9.36□□□□□ -0.91
RPN8Q08723 CPD1YGR247W 720 nt9.35□□□□□ -0.91
RPN8Q08723 ALP1YNL270C 1722 nt9.35□□□□□ -0.91
RPN8Q08723 ZRT3YKL175W 1512 nt9.35□□□□□ -0.91
RPN8Q08723 YAR028WYAR028W 705 nt9.33□□□□□ -0.92
RPN8Q08723 HMG2YLR450W 3138 nt9.32□□□□□ -0.92
RPN8Q08723 YJL067WYJL067W 351 nt9.32□□□□□ -0.92
RPN8Q08723 ESS1YJR017C 513 nt9.31□□□□□ -0.92
RPN8Q08723 YMR209CYMR209C 1374 nt9.29□□□□□ -0.92
RPN8Q08723 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.29□□□□□ -0.92
RPN8Q08723 ILV3YJR016C 1758 nt9.28□□□□□ -0.92
RPN8Q08723 UTR1YJR049C 1593 nt9.28□□□□□ -0.92
RPN8Q08723 TPO4YOR273C 1980 nt9.28□□□□□ -0.92
RPN8Q08723 APT2YDR441C 546 nt9.27□□□□□ -0.93
RPN8Q08723 NAP1YKR048C 1254 nt9.27□□□□□ -0.93
RPN8Q08723 GPN2YOR262W 1044 nt9.27□□□□□ -0.93
RPN8Q08723 YOR325WYOR325W 474 nt9.27□□□□□ -0.93
RPN8Q08723 YNL024CYNL024C 741 nt9.26□□□□□ -0.93
RPN8Q08723 DIF1YLR437C 402 nt9.24□□□□□ -0.93
RPN8Q08723 UGA4YDL210W 1716 nt9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms