Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 RPS14BYJL191W 417 nt10.36□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 YLR279WYLR279W 390 nt10.36□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.35□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 AVT6YER119C 1347 nt10.33□□□□□ -0.76
SGO1Q08490 HHO1YPL127C 777 nt10.32□□□□□ -0.76
SGO1Q08490 AAC1YMR056C 930 nt10.31□□□□□ -0.76
SGO1Q08490 YJL195CYJL195C 702 nt10.3□□□□□ -0.76
SGO1Q08490 PRP4YPR178W 1398 nt10.29□□□□□ -0.76
SGO1Q08490 CLB6YGR109C 1143 nt10.29□□□□□ -0.76
SGO1Q08490 YCR102CYCR102C 1107 nt10.27□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 RIB3YDR487C 627 nt10.27□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 RAX1YOR301W 1308 nt10.27□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 YGR012WYGR012W 1182 nt10.26□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 DPS1YLL018C 1674 nt10.25□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 BIO5YNR056C 1686 nt10.24□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 UTH1YKR042W 1098 nt10.23□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 TSC10YBR265W 963 nt10.23□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 SHH4YLR164W 507 nt10.22□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 GOR1YNL274C 1053 nt10.22□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 PBP1YGR178C 2169 nt10.21□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 ADH1YOL086C 1047 nt10.21□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 GPN2YOR262W 1044 nt10.21□□□□□ -0.77
SGO1Q08490 ESS1YJR017C 513 nt10.2□□□□□ -0.78
SGO1Q08490 DUT1YBR252W 444 nt10.2□□□□□ -0.78
SGO1Q08490 TOM6YOR045W 186 nt10.17□□□□□ -0.78
SGO1Q08490 SNF1YDR477W 1902 nt10.17□□□□□ -0.78
SGO1Q08490 HIP1YGR191W 1812 nt10.16□□□□□ -0.78
SGO1Q08490 PEX2YJL210W 816 nt10.15□□□□□ -0.78
SGO1Q08490 CPD1YGR247W 720 nt10.14□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.14□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 TIR3YIL011W 810 nt10.14□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 CYT2YKL087C 675 nt10.14□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 CMP2YML057W 1815 nt10.13□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 YEL008WYEL008W 381 nt10.13□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 HSL7YBR133C 2484 nt10.12□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 CCA1YER168C 1641 nt10.12□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 NRT1YOR071C 1797 nt10.12□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 AGP1YCL025C 1902 nt10.11□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 NBP35YGL091C 987 nt10.1□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 YPI1YFR003C 468 nt10.09□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 BMT6YLR063W 1098 nt10.09□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 MSB4YOL112W 1479 nt10.09□□□□□ -0.79
SGO1Q08490 POM34YLR018C 900 nt10.08□□□□□ -0.8
SGO1Q08490 PUP1YOR157C 786 nt10.08□□□□□ -0.8
SGO1Q08490 YKR005CYKR005C 1578 nt10.06□□□□□ -0.8
SGO1Q08490 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.05□□□□□ -0.8
SGO1Q08490 SEN2YLR105C 1134 nt10.04□□□□□ -0.8
SGO1Q08490 NAP1YKR048C 1254 nt10.03□□□□□ -0.8
SGO1Q08490 NME1NME1 340 nt10.03□□□□□ -0.8
SGO1Q08490 TIF6YPR016C 738 nt10.03□□□□□ -0.8
SGO1Q08490 MET28YIR017C 564 nt10.02□□□□□ -0.81
SGO1Q08490 YML089CYML089C 369 nt10.02□□□□□ -0.81
SGO1Q08490 LOT5YKL183W 921 nt10□□□□□ -0.81
SGO1Q08490 PRO1YDR300C 1287 nt9.99□□□□□ -0.81
SGO1Q08490 GND1YHR183W 1470 nt9.98□□□□□ -0.81
SGO1Q08490 YAT1YAR035W 2064 nt9.95□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 LSC2YGR244C 1284 nt9.94□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 ATG15YCR068W 1563 nt9.93□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 FIT3YOR383C 615 nt9.93□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 APT2YDR441C 546 nt9.91□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 IRC24YIR036C 792 nt9.91□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.91□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.91□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 YGR259CYGR259C 441 nt9.9□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 PGC1YPL206C 966 nt9.9□□□□□ -0.82
SGO1Q08490 YBR232CYBR232C 360 nt9.88□□□□□ -0.83
SGO1Q08490 YJR114WYJR114W 393 nt9.86□□□□□ -0.83
SGO1Q08490 AQY2YLL052C 450 nt9.85□□□□□ -0.83
SGO1Q08490 PAU5YFL020C 369 nt9.84□□□□□ -0.83
SGO1Q08490 STR3YGL184C 1398 nt9.84□□□□□ -0.83
SGO1Q08490 YJL064WYJL064W 396 nt9.83□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 HEL2YDR266C 1920 nt9.83□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 RIB2YOL066C 1776 nt9.83□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 SMM1YNR015W 1155 nt9.82□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.8□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 YCL074WYCL074W 927 nt9.8□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 DUS1YML080W 1272 nt9.8□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.79□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.79□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 PAU19YMR325W 375 nt9.79□□□□□ -0.84
SGO1Q08490 STP3YLR375W 1032 nt9.77□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 ZTA1YBR046C 1005 nt9.77□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 TIM44YIL022W 1296 nt9.76□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 SLG1YOR008C 1137 nt9.76□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 ARP6YLR085C 1317 nt9.76□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 GAP1YKR039W 1809 nt9.75□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 FCY21YER060W 1587 nt9.73□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 ALD4YOR374W 1560 nt9.73□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 ALP1YNL270C 1722 nt9.72□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 HXT12YIL170W 1374 nt9.72□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 SPT20YOL148C 1815 nt9.71□□□□□ -0.85
SGO1Q08490 AKR2YOR034C 2250 nt9.7□□□□□ -0.86
SGO1Q08490 YAR028WYAR028W 705 nt9.7□□□□□ -0.86
SGO1Q08490 MTG2YHR168W 1557 nt9.67□□□□□ -0.86
SGO1Q08490 PRY1YJL079C 900 nt9.66□□□□□ -0.86
SGO1Q08490 DIF1YLR437C 402 nt9.66□□□□□ -0.86
SGO1Q08490 RIB1YBL033C 1038 nt9.66□□□□□ -0.86
SGO1Q08490 VRG4YGL225W 1014 nt9.64□□□□□ -0.87
SGO1Q08490 RIM8YGL045W 1629 nt9.64□□□□□ -0.87
SGO1Q08490 RPC82YPR190C 1965 nt9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms