Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.38□□□□□ -0.59
HRQ1Q05549 TOM6YOR045W 186 nt11.36□□□□□ -0.59
HRQ1Q05549 ATG15YCR068W 1563 nt11.36□□□□□ -0.59
HRQ1Q05549 UBX6YJL048C 1191 nt11.34□□□□□ -0.59
HRQ1Q05549 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.33□□□□□ -0.6
HRQ1Q05549 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.33□□□□□ -0.6
HRQ1Q05549 UBA4YHR111W 1323 nt11.33□□□□□ -0.6
HRQ1Q05549 RET2YFR051C 1641 nt11.32□□□□□ -0.6
HRQ1Q05549 PHO89YBR296C 1725 nt11.31□□□□□ -0.6
HRQ1Q05549 CMP2YML057W 1815 nt11.28□□□□□ -0.6
HRQ1Q05549 THI74YDR438W 1113 nt11.27□□□□□ -0.61
HRQ1Q05549 PEX2YJL210W 816 nt11.26□□□□□ -0.61
HRQ1Q05549 DIF1YLR437C 402 nt11.25□□□□□ -0.61
HRQ1Q05549 YML089CYML089C 369 nt11.25□□□□□ -0.61
HRQ1Q05549 YSR3YKR053C 1215 nt11.23□□□□□ -0.61
HRQ1Q05549 COQ2YNR041C 1119 nt11.23□□□□□ -0.61
HRQ1Q05549 SAM35YHR083W 990 nt11.22□□□□□ -0.61
HRQ1Q05549 TIF6YPR016C 738 nt11.21□□□□□ -0.61
HRQ1Q05549 RPC82YPR190C 1965 nt11.19□□□□□ -0.62
HRQ1Q05549 XYL2YLR070C 1071 nt11.19□□□□□ -0.62
HRQ1Q05549 NDI1YML120C 1542 nt11.19□□□□□ -0.62
HRQ1Q05549 HIP1YGR191W 1812 nt11.18□□□□□ -0.62
HRQ1Q05549 DBP1YPL119C 1854 nt11.15□□□□□ -0.62
HRQ1Q05549 NAT4YMR069W 858 nt11.15□□□□□ -0.62
HRQ1Q05549 MSF1YPR047W 1410 nt11.15□□□□□ -0.62
HRQ1Q05549 INA1YLR413W 2028 nt11.14□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 ZRT3YKL175W 1512 nt11.14□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.13□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.13□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.13□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.13□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.13□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 HXT1YHR094C 1713 nt11.12□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 MRP20YDR405W 792 nt11.12□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 SPT20YOL148C 1815 nt11.11□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 YGL034CYGL034C 366 nt11.1□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 YJL067WYJL067W 351 nt11.1□□□□□ -0.63
HRQ1Q05549 SHY1YGR112W 1170 nt11.07□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 MET28YIR017C 564 nt11.06□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 YBL086CYBL086C 1401 nt11.06□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.05□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.05□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 YCR087WYCR087W 516 nt11.05□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 MTG2YHR168W 1557 nt11.05□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 YAR028WYAR028W 705 nt11.05□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 ZTA1YBR046C 1005 nt11.04□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 NRT1YOR071C 1797 nt11.03□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 LIP1YMR298W 453 nt11.03□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 AIM45YPR004C 1035 nt11.03□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 HSL7YBR133C 2484 nt11.03□□□□□ -0.64
HRQ1Q05549 NME1NME1 340 nt11.01□□□□□ -0.65
HRQ1Q05549 RPL4BYDR012W 1089 nt11□□□□□ -0.65
HRQ1Q05549 SED1YDR077W 1017 nt11□□□□□ -0.65
HRQ1Q05549 RPL4AYBR031W 1089 nt11□□□□□ -0.65
HRQ1Q05549 UTH1YKR042W 1098 nt10.99□□□□□ -0.65
HRQ1Q05549 AKR2YOR034C 2250 nt10.98□□□□□ -0.65
HRQ1Q05549 RPS14BYJL191W 417 nt10.97□□□□□ -0.65
HRQ1Q05549 RBG1YAL036C 1110 nt10.97□□□□□ -0.65
HRQ1Q05549 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.96□□□□□ -0.65
HRQ1Q05549 CLB6YGR109C 1143 nt10.95□□□□□ -0.66
HRQ1Q05549 YPL251WYPL251W 303 nt10.95□□□□□ -0.66
HRQ1Q05549 UFO1YML088W 2007 nt10.92□□□□□ -0.66
HRQ1Q05549 BRR1YPR057W 1026 nt10.92□□□□□ -0.66
HRQ1Q05549 LEU9YOR108W 1815 nt10.91□□□□□ -0.66
HRQ1Q05549 TOA2YKL058W 369 nt10.91□□□□□ -0.66
HRQ1Q05549 SBA1YKL117W 651 nt10.91□□□□□ -0.66
HRQ1Q05549 SAM1YLR180W 1149 nt10.91□□□□□ -0.66
HRQ1Q05549 ALP1YNL270C 1722 nt10.91□□□□□ -0.66
HRQ1Q05549 YOR325WYOR325W 474 nt10.89□□□□□ -0.67
HRQ1Q05549 URA6YKL024C 615 nt10.88□□□□□ -0.67
HRQ1Q05549 GND2YGR256W 1479 nt10.87□□□□□ -0.67
HRQ1Q05549 FIT3YOR383C 615 nt10.87□□□□□ -0.67
HRQ1Q05549 MUP1YGR055W 1725 nt10.86□□□□□ -0.67
HRQ1Q05549 YMR103CYMR103C 363 nt10.85□□□□□ -0.67
HRQ1Q05549 HOL1YNR055C 1761 nt10.83□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 OYE3YPL171C 1203 nt10.83□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 YNL024CYNL024C 741 nt10.82□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 MEP3YPR138C 1470 nt10.81□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 CWC15YDR163W 528 nt10.81□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 YLR279WYLR279W 390 nt10.8□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.79□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.79□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 ILV3YJR016C 1758 nt10.79□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 UGA4YDL210W 1716 nt10.78□□□□□ -0.68
HRQ1Q05549 MSB4YOL112W 1479 nt10.77□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 PET8YNL003C 855 nt10.77□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 TSC10YBR265W 963 nt10.76□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 SDH5YOL071W 489 nt10.75□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 RIM8YGL045W 1629 nt10.75□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 FLR1YBR008C 1647 nt10.74□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 YGR012WYGR012W 1182 nt10.74□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 FMS1YMR020W 1527 nt10.74□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 SPP2YOR148C 558 nt10.72□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 ACH1YBL015W 1581 nt10.71□□□□□ -0.69
HRQ1Q05549 CCT2YIL142W 1584 nt10.7□□□□□ -0.7
HRQ1Q05549 RSC8YFR037C 1674 nt10.69□□□□□ -0.7
HRQ1Q05549 SAM2YDR502C 1155 nt10.68□□□□□ -0.7
HRQ1Q05549 OPI10YOL032W 741 nt10.67□□□□□ -0.7
HRQ1Q05549 YPS3YLR121C 1527 nt10.67□□□□□ -0.7
HRQ1Q05549 CAB5YDR196C 726 nt10.66□□□□□ -0.7
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