Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 RET2YFR051C 1641 nt8.85□□□□□ -0.99
AVT7P40501 NBP35YGL091C 987 nt8.85□□□□□ -0.99
AVT7P40501 XYL2YLR070C 1071 nt8.85□□□□□ -0.99
AVT7P40501 PHO89YBR296C 1725 nt8.85□□□□□ -0.99
AVT7P40501 NDI1YML120C 1542 nt8.85□□□□□ -0.99
AVT7P40501 ARP6YLR085C 1317 nt8.82□□□□□ -1
AVT7P40501 RBG1YAL036C 1110 nt8.82□□□□□ -1
AVT7P40501 PLB1YMR008C 1995 nt8.81□□□□□ -1
AVT7P40501 AIM45YPR004C 1035 nt8.8□□□□□ -1
AVT7P40501 MRP20YDR405W 792 nt8.78□□□□□ -1
AVT7P40501 ALD4YOR374W 1560 nt8.74□□□□□ -1.01
AVT7P40501 YAT1YAR035W 2064 nt8.73□□□□□ -1.01
AVT7P40501 RBG2YGR173W 1107 nt8.73□□□□□ -1.01
AVT7P40501 PRM5YIL117C 957 nt8.73□□□□□ -1.01
AVT7P40501 HIF1YLL022C 1158 nt8.73□□□□□ -1.01
AVT7P40501 HSL7YBR133C 2484 nt8.71□□□□□ -1.02
AVT7P40501 LSC2YGR244C 1284 nt8.7□□□□□ -1.02
AVT7P40501 YMR226CYMR226C 804 nt8.7□□□□□ -1.02
AVT7P40501 COQ2YNR041C 1119 nt8.7□□□□□ -1.02
AVT7P40501 TIR3YIL011W 810 nt8.69□□□□□ -1.02
AVT7P40501 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.68□□□□□ -1.02
AVT7P40501 UTR1YJR049C 1593 nt8.67□□□□□ -1.02
AVT7P40501 GAP1YKR039W 1809 nt8.66□□□□□ -1.02
AVT7P40501 SFA1YDL168W 1161 nt8.66□□□□□ -1.02
AVT7P40501 CLB6YGR109C 1143 nt8.65□□□□□ -1.02
AVT7P40501 SAM35YHR083W 990 nt8.65□□□□□ -1.02
AVT7P40501 RPL4BYDR012W 1089 nt8.64□□□□□ -1.03
AVT7P40501 RPL4AYBR031W 1089 nt8.64□□□□□ -1.03
AVT7P40501 YLR111WYLR111W 333 nt8.63□□□□□ -1.03
AVT7P40501 INA1YLR413W 2028 nt8.63□□□□□ -1.03
AVT7P40501 PRO1YDR300C 1287 nt8.62□□□□□ -1.03
AVT7P40501 SHH4YLR164W 507 nt8.61□□□□□ -1.03
AVT7P40501 SPT20YOL148C 1815 nt8.61□□□□□ -1.03
AVT7P40501 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.6□□□□□ -1.03
AVT7P40501 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.6□□□□□ -1.03
AVT7P40501 UTH1YKR042W 1098 nt8.59□□□□□ -1.03
AVT7P40501 POM34YLR018C 900 nt8.59□□□□□ -1.03
AVT7P40501 SDH5YOL071W 489 nt8.59□□□□□ -1.03
AVT7P40501 ZRT3YKL175W 1512 nt8.58□□□□□ -1.04
AVT7P40501 HEL2YDR266C 1920 nt8.58□□□□□ -1.04
AVT7P40501 ATG15YCR068W 1563 nt8.57□□□□□ -1.04
AVT7P40501 YML089CYML089C 369 nt8.57□□□□□ -1.04
AVT7P40501 RPS14BYJL191W 417 nt8.56□□□□□ -1.04
AVT7P40501 RPC82YPR190C 1965 nt8.55□□□□□ -1.04
AVT7P40501 TOM6YOR045W 186 nt8.54□□□□□ -1.04
AVT7P40501 RAD23YEL037C 1197 nt8.52□□□□□ -1.05
AVT7P40501 PEX2YJL210W 816 nt8.52□□□□□ -1.05
AVT7P40501 RPM1RPM1 483 nt8.52□□□□□ -1.05
AVT7P40501 DIF1YLR437C 402 nt8.51□□□□□ -1.05
AVT7P40501 TSC10YBR265W 963 nt8.51□□□□□ -1.05
AVT7P40501 NRT1YOR071C 1797 nt8.5□□□□□ -1.05
AVT7P40501 HIP1YGR191W 1812 nt8.5□□□□□ -1.05
AVT7P40501 SAM1YLR180W 1149 nt8.5□□□□□ -1.05
AVT7P40501 HXT1YHR094C 1713 nt8.48□□□□□ -1.05
AVT7P40501 MET28YIR017C 564 nt8.47□□□□□ -1.05
AVT7P40501 YJL067WYJL067W 351 nt8.46□□□□□ -1.06
AVT7P40501 DBP1YPL119C 1854 nt8.46□□□□□ -1.06
AVT7P40501 YGR012WYGR012W 1182 nt8.45□□□□□ -1.06
AVT7P40501 TIF6YPR016C 738 nt8.45□□□□□ -1.06
AVT7P40501 FIT3YOR383C 615 nt8.42□□□□□ -1.06
AVT7P40501 RIB3YDR487C 627 nt8.4□□□□□ -1.06
AVT7P40501 SHY1YGR112W 1170 nt8.4□□□□□ -1.06
AVT7P40501 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.4□□□□□ -1.06
AVT7P40501 RIM8YGL045W 1629 nt8.4□□□□□ -1.07
AVT7P40501 YAR028WYAR028W 705 nt8.39□□□□□ -1.07
AVT7P40501 YLR279WYLR279W 390 nt8.38□□□□□ -1.07
AVT7P40501 LIP1YMR298W 453 nt8.38□□□□□ -1.07
AVT7P40501 SED1YDR077W 1017 nt8.37□□□□□ -1.07
AVT7P40501 YBL086CYBL086C 1401 nt8.36□□□□□ -1.07
AVT7P40501 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.34□□□□□ -1.07
AVT7P40501 MET2YNL277W 1461 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT7P40501 CAB5YDR196C 726 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT7P40501 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT7P40501 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT7P40501 URA6YKL024C 615 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT7P40501 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT7P40501 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT7P40501 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT7P40501 ILV3YJR016C 1758 nt8.31□□□□□ -1.08
AVT7P40501 MUP1YGR055W 1725 nt8.31□□□□□ -1.08
AVT7P40501 MSB4YOL112W 1479 nt8.31□□□□□ -1.08
AVT7P40501 YGL114WYGL114W 2178 nt8.31□□□□□ -1.08
AVT7P40501 MTG2YHR168W 1557 nt8.31□□□□□ -1.08
AVT7P40501 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.29□□□□□ -1.08
AVT7P40501 YNL024CYNL024C 741 nt8.29□□□□□ -1.08
AVT7P40501 HOL1YNR055C 1761 nt8.29□□□□□ -1.08
AVT7P40501 AKR2YOR034C 2250 nt8.28□□□□□ -1.08
AVT7P40501 MAE1YKL029C 2010 nt8.27□□□□□ -1.09
AVT7P40501 LEU9YOR108W 1815 nt8.27□□□□□ -1.09
AVT7P40501 ALP1YNL270C 1722 nt8.27□□□□□ -1.09
AVT7P40501 CWC15YDR163W 528 nt8.27□□□□□ -1.09
AVT7P40501 UFO1YML088W 2007 nt8.26□□□□□ -1.09
AVT7P40501 TOA2YKL058W 369 nt8.26□□□□□ -1.09
AVT7P40501 YOR325WYOR325W 474 nt8.26□□□□□ -1.09
AVT7P40501 YPI1YFR003C 468 nt8.25□□□□□ -1.09
AVT7P40501 STE4YOR212W 1272 nt8.25□□□□□ -1.09
AVT7P40501 BRR1YPR057W 1026 nt8.25□□□□□ -1.09
AVT7P40501 YJL195CYJL195C 702 nt8.24□□□□□ -1.09
AVT7P40501 PET8YNL003C 855 nt8.24□□□□□ -1.09
AVT7P40501 ZTA1YBR046C 1005 nt8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58 ms