Protein–RNA interactions for Protein: P40463

VHS2, Protein VHS2, yeastyeast

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS2P40463 RDN18-2RDN18-2 1800 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS2P40463 NDI1YML120C 1542 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS2P40463 NIT1YIL164C 600 nt7.67□□□□□ -1.18
VHS2P40463 SGT2YOR007C 1041 nt7.67□□□□□ -1.18
VHS2P40463 RRT5YFR032C 870 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS2P40463 AQY2YLL052C 450 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS2P40463 PRE6YOL038W 765 nt7.66□□□□□ -1.18
VHS2P40463 PAU7YAR020C 168 nt7.63□□□□□ -1.19
VHS2P40463 YCR102CYCR102C 1107 nt7.62□□□□□ -1.19
VHS2P40463 RTN2YDL204W 1182 nt7.62□□□□□ -1.19
VHS2P40463 NPP1YCR026C 2229 nt7.59□□□□□ -1.19
VHS2P40463 SPT20YOL148C 1815 nt7.58□□□□□ -1.2
VHS2P40463 PAU16YKL224C 372 nt7.58□□□□□ -1.2
VHS2P40463 NBP35YGL091C 987 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS2P40463 ARP6YLR085C 1317 nt7.54□□□□□ -1.2
VHS2P40463 MIR1YJR077C 936 nt7.52□□□□□ -1.21
VHS2P40463 SHB17YKR043C 816 nt7.52□□□□□ -1.21
VHS2P40463 MET8YBR213W 825 nt7.52□□□□□ -1.21
VHS2P40463 RPC82YPR190C 1965 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS2P40463 HEL2YDR266C 1920 nt7.51□□□□□ -1.21
VHS2P40463 MET2YNL277W 1461 nt7.49□□□□□ -1.21
VHS2P40463 CLB6YGR109C 1143 nt7.49□□□□□ -1.21
VHS2P40463 LSC2YGR244C 1284 nt7.49□□□□□ -1.21
VHS2P40463 YDR010CYDR010C 333 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS2P40463 THI74YDR438W 1113 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS2P40463 TIR3YIL011W 810 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS2P40463 NAT4YMR069W 858 nt7.48□□□□□ -1.21
VHS2P40463 UBA4YHR111W 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
VHS2P40463 PLB1YMR008C 1995 nt7.46□□□□□ -1.21
VHS2P40463 GAL2YLR081W 1725 nt7.46□□□□□ -1.22
VHS2P40463 INA1YLR413W 2028 nt7.45□□□□□ -1.22
VHS2P40463 RET2YFR051C 1641 nt7.45□□□□□ -1.22
VHS2P40463 SFP1YLR403W 2052 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS2P40463 YSR3YKR053C 1215 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS2P40463 SHH4YLR164W 507 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS2P40463 PHO89YBR296C 1725 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS2P40463 YGL114WYGL114W 2178 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS2P40463 MSF1YPR047W 1410 nt7.43□□□□□ -1.22
VHS2P40463 PAB1YER165W 1734 nt7.42□□□□□ -1.22
VHS2P40463 TOK1YJL093C 2076 nt7.41□□□□□ -1.22
VHS2P40463 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.41□□□□□ -1.22
VHS2P40463 SFA1YDL168W 1161 nt7.4□□□□□ -1.22
VHS2P40463 PRO1YDR300C 1287 nt7.4□□□□□ -1.22
VHS2P40463 HIF1YLL022C 1158 nt7.4□□□□□ -1.22
VHS2P40463 GTB1YDR221W 2109 nt7.4□□□□□ -1.23
VHS2P40463 GAP1YKR039W 1809 nt7.39□□□□□ -1.23
VHS2P40463 POM34YLR018C 900 nt7.39□□□□□ -1.23
VHS2P40463 YML089CYML089C 369 nt7.39□□□□□ -1.23
VHS2P40463 YCR087WYCR087W 516 nt7.38□□□□□ -1.23
VHS2P40463 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.38□□□□□ -1.23
VHS2P40463 NAS6YGR232W 687 nt7.38□□□□□ -1.23
VHS2P40463 ATG15YCR068W 1563 nt7.37□□□□□ -1.23
VHS2P40463 YMR244WYMR244W 1068 nt7.37□□□□□ -1.23
VHS2P40463 FRA1YLL029W 2250 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS2P40463 MRP20YDR405W 792 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS2P40463 YGL034CYGL034C 366 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS2P40463 XYL2YLR070C 1071 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS2P40463 TOM6YOR045W 186 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS2P40463 RIM8YGL045W 1629 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS2P40463 UTR1YJR049C 1593 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS2P40463 ALD4YOR374W 1560 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS2P40463 COQ2YNR041C 1119 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS2P40463 PRM5YIL117C 957 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS2P40463 MUP1YGR055W 1725 nt7.32□□□□□ -1.24
VHS2P40463 HOL1YNR055C 1761 nt7.31□□□□□ -1.24
VHS2P40463 SAM35YHR083W 990 nt7.31□□□□□ -1.24
VHS2P40463 PEX2YJL210W 816 nt7.31□□□□□ -1.24
VHS2P40463 MAE1YKL029C 2010 nt7.3□□□□□ -1.24
VHS2P40463 AIM45YPR004C 1035 nt7.3□□□□□ -1.24
VHS2P40463 HIP1YGR191W 1812 nt7.29□□□□□ -1.24
VHS2P40463 DIF1YLR437C 402 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS2P40463 AAC3YBR085W 924 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS2P40463 ZRT3YKL175W 1512 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS2P40463 RPL4BYDR012W 1089 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS2P40463 RPL4AYBR031W 1089 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS2P40463 TIF6YPR016C 738 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS2P40463 RBG1YAL036C 1110 nt7.26□□□□□ -1.25
VHS2P40463 MET28YIR017C 564 nt7.25□□□□□ -1.25
VHS2P40463 UTH1YKR042W 1098 nt7.25□□□□□ -1.25
VHS2P40463 CBK1YNL161W 2271 nt7.25□□□□□ -1.25
VHS2P40463 NRT1YOR071C 1797 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS2P40463 HXT10YFL011W 1641 nt7.23□□□□□ -1.25
VHS2P40463 MLS1YNL117W 1665 nt7.22□□□□□ -1.25
VHS2P40463 DBP1YPL119C 1854 nt7.21□□□□□ -1.25
VHS2P40463 YAR028WYAR028W 705 nt7.2□□□□□ -1.26
VHS2P40463 ILV3YJR016C 1758 nt7.2□□□□□ -1.26
VHS2P40463 RPS14BYJL191W 417 nt7.19□□□□□ -1.26
VHS2P40463 ACO2YJL200C 2370 nt7.19□□□□□ -1.26
VHS2P40463 YJL067WYJL067W 351 nt7.18□□□□□ -1.26
VHS2P40463 MGM101YJR144W 810 nt7.18□□□□□ -1.26
VHS2P40463 YHR131CYHR131C 2553 nt7.18□□□□□ -1.26
VHS2P40463 FIT3YOR383C 615 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS2P40463 YRF1-2YER190W 5046 nt7.16□□□□□ -1.26
VHS2P40463 HXT1YHR094C 1713 nt7.15□□□□□ -1.26
VHS2P40463 NSG2YNL156C 900 nt7.15□□□□□ -1.26
VHS2P40463 MTG2YHR168W 1557 nt7.15□□□□□ -1.27
VHS2P40463 YLR173WYLR173W 1827 nt7.14□□□□□ -1.27
VHS2P40463 HMG2YLR450W 3138 nt7.14□□□□□ -1.27
VHS2P40463 ALP1YNL270C 1722 nt7.14□□□□□ -1.27
VHS2P40463 SED1YDR077W 1017 nt7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.1 ms