Protein–RNA interactions for Protein: P39986

SPF1, Manganese-transporting ATPase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPF1P39986 BMT6YLR063W 1098 nt9.89□□□□□ -0.83
SPF1P39986 YGL034CYGL034C 366 nt9.88□□□□□ -0.83
SPF1P39986 PHO89YBR296C 1725 nt9.87□□□□□ -0.83
SPF1P39986 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.87□□□□□ -0.83
SPF1P39986 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.87□□□□□ -0.83
SPF1P39986 YCR087WYCR087W 516 nt9.87□□□□□ -0.83
SPF1P39986 PBP1YGR178C 2169 nt9.87□□□□□ -0.83
SPF1P39986 RSC4YKR008W 1878 nt9.84□□□□□ -0.83
SPF1P39986 TIR3YIL011W 810 nt9.83□□□□□ -0.84
SPF1P39986 XYL2YLR070C 1071 nt9.82□□□□□ -0.84
SPF1P39986 YGR259CYGR259C 441 nt9.81□□□□□ -0.84
SPF1P39986 CYT2YKL087C 675 nt9.8□□□□□ -0.84
SPF1P39986 SFA1YDL168W 1161 nt9.79□□□□□ -0.84
SPF1P39986 MRP20YDR405W 792 nt9.79□□□□□ -0.84
SPF1P39986 IRC24YIR036C 792 nt9.79□□□□□ -0.84
SPF1P39986 SBA1YKL117W 651 nt9.79□□□□□ -0.84
SPF1P39986 RTN2YDL204W 1182 nt9.78□□□□□ -0.84
SPF1P39986 LSC2YGR244C 1284 nt9.78□□□□□ -0.84
SPF1P39986 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.78□□□□□ -0.84
SPF1P39986 AIM45YPR004C 1035 nt9.77□□□□□ -0.85
SPF1P39986 COQ2YNR041C 1119 nt9.75□□□□□ -0.85
SPF1P39986 ARP6YLR085C 1317 nt9.75□□□□□ -0.85
SPF1P39986 SHH4YLR164W 507 nt9.74□□□□□ -0.85
SPF1P39986 MAS1YLR163C 1389 nt9.74□□□□□ -0.85
SPF1P39986 RBG1YAL036C 1110 nt9.73□□□□□ -0.85
SPF1P39986 YML089CYML089C 369 nt9.73□□□□□ -0.85
SPF1P39986 POM34YLR018C 900 nt9.72□□□□□ -0.85
SPF1P39986 NDI1YML120C 1542 nt9.72□□□□□ -0.85
SPF1P39986 PRO1YDR300C 1287 nt9.69□□□□□ -0.86
SPF1P39986 RPL4BYDR012W 1089 nt9.68□□□□□ -0.86
SPF1P39986 TOM6YOR045W 186 nt9.68□□□□□ -0.86
SPF1P39986 RPL4AYBR031W 1089 nt9.68□□□□□ -0.86
SPF1P39986 PAU21YOR394W 495 nt9.68□□□□□ -0.86
SPF1P39986 PAU22YPL282C 495 nt9.68□□□□□ -0.86
SPF1P39986 CMP2YML057W 1815 nt9.66□□□□□ -0.86
SPF1P39986 GLR1YPL091W 1452 nt9.65□□□□□ -0.87
SPF1P39986 PLB1YMR008C 1995 nt9.64□□□□□ -0.87
SPF1P39986 ATG15YCR068W 1563 nt9.64□□□□□ -0.87
SPF1P39986 UTH1YKR042W 1098 nt9.63□□□□□ -0.87
SPF1P39986 GAP1YKR039W 1809 nt9.63□□□□□ -0.87
SPF1P39986 PEX2YJL210W 816 nt9.62□□□□□ -0.87
SPF1P39986 HIP1YGR191W 1812 nt9.61□□□□□ -0.87
SPF1P39986 YMR244WYMR244W 1068 nt9.6□□□□□ -0.87
SPF1P39986 SSN3YPL042C 1668 nt9.6□□□□□ -0.87
SPF1P39986 MCM5YLR274W 2328 nt9.59□□□□□ -0.87
SPF1P39986 RPS14BYJL191W 417 nt9.59□□□□□ -0.87
SPF1P39986 TIF6YPR016C 738 nt9.59□□□□□ -0.87
SPF1P39986 MET28YIR017C 564 nt9.58□□□□□ -0.88
SPF1P39986 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.57□□□□□ -0.88
SPF1P39986 NRT1YOR071C 1797 nt9.57□□□□□ -0.88
SPF1P39986 HSL7YBR133C 2484 nt9.56□□□□□ -0.88
SPF1P39986 ARO7YPR060C 771 nt9.56□□□□□ -0.88
SPF1P39986 YAT1YAR035W 2064 nt9.55□□□□□ -0.88
SPF1P39986 NAS6YGR232W 687 nt9.54□□□□□ -0.88
SPF1P39986 YPL041CYPL041C 624 nt9.54□□□□□ -0.88
SPF1P39986 YDR306CYDR306C 1437 nt9.52□□□□□ -0.89
SPF1P39986 UTR1YJR049C 1593 nt9.51□□□□□ -0.89
SPF1P39986 YMR226CYMR226C 804 nt9.51□□□□□ -0.89
SPF1P39986 FIT3YOR383C 615 nt9.51□□□□□ -0.89
SPF1P39986 SAM35YHR083W 990 nt9.5□□□□□ -0.89
SPF1P39986 SDH5YOL071W 489 nt9.5□□□□□ -0.89
SPF1P39986 TSC10YBR265W 963 nt9.5□□□□□ -0.89
SPF1P39986 DIF1YLR437C 402 nt9.49□□□□□ -0.89
SPF1P39986 PUS7YOR243C 2031 nt9.48□□□□□ -0.89
SPF1P39986 YLR111WYLR111W 333 nt9.47□□□□□ -0.89
SPF1P39986 COG1YGL223C 1254 nt9.46□□□□□ -0.9
SPF1P39986 RAD23YEL037C 1197 nt9.45□□□□□ -0.9
SPF1P39986 RBG2YGR173W 1107 nt9.45□□□□□ -0.9
SPF1P39986 YAR028WYAR028W 705 nt9.45□□□□□ -0.9
SPF1P39986 PRM5YIL117C 957 nt9.44□□□□□ -0.9
SPF1P39986 YGR012WYGR012W 1182 nt9.42□□□□□ -0.9
SPF1P39986 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.41□□□□□ -0.9
SPF1P39986 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.41□□□□□ -0.9
SPF1P39986 YLR279WYLR279W 390 nt9.4□□□□□ -0.9
SPF1P39986 ALD4YOR374W 1560 nt9.39□□□□□ -0.91
SPF1P39986 URH1YDR400W 1023 nt9.39□□□□□ -0.91
SPF1P39986 ALP1YNL270C 1722 nt9.39□□□□□ -0.91
SPF1P39986 SPT20YOL148C 1815 nt9.37□□□□□ -0.91
SPF1P39986 MTG2YHR168W 1557 nt9.37□□□□□ -0.91
SPF1P39986 AKR2YOR034C 2250 nt9.35□□□□□ -0.91
SPF1P39986 LCP5YER127W 1074 nt9.34□□□□□ -0.91
SPF1P39986 RIB3YDR487C 627 nt9.33□□□□□ -0.92
SPF1P39986 HIF1YLL022C 1158 nt9.33□□□□□ -0.92
SPF1P39986 RPC82YPR190C 1965 nt9.33□□□□□ -0.92
SPF1P39986 SED1YDR077W 1017 nt9.32□□□□□ -0.92
SPF1P39986 ZTA1YBR046C 1005 nt9.32□□□□□ -0.92
SPF1P39986 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.32□□□□□ -0.92
SPF1P39986 MSB4YOL112W 1479 nt9.32□□□□□ -0.92
SPF1P39986 HEL2YDR266C 1920 nt9.31□□□□□ -0.92
SPF1P39986 FTH1YBR207W 1398 nt9.3□□□□□ -0.92
SPF1P39986 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.3□□□□□ -0.92
SPF1P39986 INA1YLR413W 2028 nt9.29□□□□□ -0.92
SPF1P39986 LIP1YMR298W 453 nt9.28□□□□□ -0.92
SPF1P39986 YJL118WYJL118W 660 nt9.27□□□□□ -0.93
SPF1P39986 HXT1YHR094C 1713 nt9.27□□□□□ -0.93
SPF1P39986 DBP1YPL119C 1854 nt9.27□□□□□ -0.93
SPF1P39986 FAF1YIL019W 1041 nt9.26□□□□□ -0.93
SPF1P39986 AI5_BETAQ0075 1065 nt9.25□□□□□ -0.93
SPF1P39986 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.25□□□□□ -0.93
SPF1P39986 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.4 ms