Protein–RNA interactions for Protein: P38925

SMF1, Manganese transporter SMF1, yeastyeast

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF1P38925 POM34YLR018C 900 nt10.54□□□□□ -0.72
SMF1P38925 RPC82YPR190C 1965 nt10.54□□□□□ -0.72
SMF1P38925 YDR010CYDR010C 333 nt10.53□□□□□ -0.72
SMF1P38925 HSL7YBR133C 2484 nt10.52□□□□□ -0.72
SMF1P38925 SFA1YDL168W 1161 nt10.5□□□□□ -0.73
SMF1P38925 PAU7YAR020C 168 nt10.5□□□□□ -0.73
SMF1P38925 SHB17YKR043C 816 nt10.49□□□□□ -0.73
SMF1P38925 ATG15YCR068W 1563 nt10.48□□□□□ -0.73
SMF1P38925 SPT20YOL148C 1815 nt10.47□□□□□ -0.73
SMF1P38925 INA1YLR413W 2028 nt10.46□□□□□ -0.74
SMF1P38925 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.45□□□□□ -0.74
SMF1P38925 TOM6YOR045W 186 nt10.45□□□□□ -0.74
SMF1P38925 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.43□□□□□ -0.74
SMF1P38925 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.43□□□□□ -0.74
SMF1P38925 SAM35YHR083W 990 nt10.43□□□□□ -0.74
SMF1P38925 DIF1YLR437C 402 nt10.42□□□□□ -0.74
SMF1P38925 MIR1YJR077C 936 nt10.41□□□□□ -0.74
SMF1P38925 ZRT3YKL175W 1512 nt10.41□□□□□ -0.74
SMF1P38925 YML089CYML089C 369 nt10.4□□□□□ -0.74
SMF1P38925 RET2YFR051C 1641 nt10.4□□□□□ -0.75
SMF1P38925 DBP1YPL119C 1854 nt10.38□□□□□ -0.75
SMF1P38925 SBA1YKL117W 651 nt10.37□□□□□ -0.75
SMF1P38925 YJL067WYJL067W 351 nt10.36□□□□□ -0.75
SMF1P38925 UBA4YHR111W 1323 nt10.34□□□□□ -0.75
SMF1P38925 PHO89YBR296C 1725 nt10.34□□□□□ -0.75
SMF1P38925 PEX2YJL210W 816 nt10.34□□□□□ -0.75
SMF1P38925 NAT4YMR069W 858 nt10.34□□□□□ -0.75
SMF1P38925 TIF6YPR016C 738 nt10.34□□□□□ -0.75
SMF1P38925 HXT1YHR094C 1713 nt10.33□□□□□ -0.76
SMF1P38925 HIP1YGR191W 1812 nt10.3□□□□□ -0.76
SMF1P38925 SHY1YGR112W 1170 nt10.29□□□□□ -0.76
SMF1P38925 COQ2YNR041C 1119 nt10.29□□□□□ -0.76
SMF1P38925 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SMF1P38925 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SMF1P38925 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SMF1P38925 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SMF1P38925 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SMF1P38925 THI74YDR438W 1113 nt10.26□□□□□ -0.77
SMF1P38925 YBL086CYBL086C 1401 nt10.25□□□□□ -0.77
SMF1P38925 YSR3YKR053C 1215 nt10.25□□□□□ -0.77
SMF1P38925 YAR028WYAR028W 705 nt10.22□□□□□ -0.77
SMF1P38925 LIP1YMR298W 453 nt10.22□□□□□ -0.77
SMF1P38925 MSF1YPR047W 1410 nt10.22□□□□□ -0.77
SMF1P38925 MTG2YHR168W 1557 nt10.22□□□□□ -0.77
SMF1P38925 MUP1YGR055W 1725 nt10.21□□□□□ -0.77
SMF1P38925 HOL1YNR055C 1761 nt10.2□□□□□ -0.78
SMF1P38925 SED1YDR077W 1017 nt10.19□□□□□ -0.78
SMF1P38925 MET28YIR017C 564 nt10.19□□□□□ -0.78
SMF1P38925 XYL2YLR070C 1071 nt10.19□□□□□ -0.78
SMF1P38925 MRP20YDR405W 792 nt10.17□□□□□ -0.78
SMF1P38925 YOR325WYOR325W 474 nt10.17□□□□□ -0.78
SMF1P38925 ZTA1YBR046C 1005 nt10.17□□□□□ -0.78
SMF1P38925 UFO1YML088W 2007 nt10.16□□□□□ -0.78
SMF1P38925 RIM8YGL045W 1629 nt10.15□□□□□ -0.79
SMF1P38925 NRT1YOR071C 1797 nt10.14□□□□□ -0.79
SMF1P38925 LEU9YOR108W 1815 nt10.14□□□□□ -0.79
SMF1P38925 YCR087WYCR087W 516 nt10.13□□□□□ -0.79
SMF1P38925 URA6YKL024C 615 nt10.13□□□□□ -0.79
SMF1P38925 YPL251WYPL251W 303 nt10.13□□□□□ -0.79
SMF1P38925 ILV3YJR016C 1758 nt10.12□□□□□ -0.79
SMF1P38925 AKR2YOR034C 2250 nt10.12□□□□□ -0.79
SMF1P38925 YGL034CYGL034C 366 nt10.11□□□□□ -0.79
SMF1P38925 YNL024CYNL024C 741 nt10.11□□□□□ -0.79
SMF1P38925 UTH1YKR042W 1098 nt10.1□□□□□ -0.79
SMF1P38925 SAM1YLR180W 1149 nt10.1□□□□□ -0.79
SMF1P38925 RPL4BYDR012W 1089 nt10.09□□□□□ -0.79
SMF1P38925 RPL4AYBR031W 1089 nt10.09□□□□□ -0.79
SMF1P38925 AIM45YPR004C 1035 nt10.09□□□□□ -0.79
SMF1P38925 BRR1YPR057W 1026 nt10.09□□□□□ -0.79
SMF1P38925 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.08□□□□□ -0.8
SMF1P38925 TOA2YKL058W 369 nt10.08□□□□□ -0.8
SMF1P38925 ALP1YNL270C 1722 nt10.07□□□□□ -0.8
SMF1P38925 YGL114WYGL114W 2178 nt10.07□□□□□ -0.8
SMF1P38925 RPS14BYJL191W 417 nt10.07□□□□□ -0.8
SMF1P38925 HEL2YDR266C 1920 nt10.06□□□□□ -0.8
SMF1P38925 CWC15YDR163W 528 nt10.06□□□□□ -0.8
SMF1P38925 CLB6YGR109C 1143 nt10.06□□□□□ -0.8
SMF1P38925 OYE3YPL171C 1203 nt10.05□□□□□ -0.8
SMF1P38925 GND2YGR256W 1479 nt10.04□□□□□ -0.8
SMF1P38925 FIT3YOR383C 615 nt10.03□□□□□ -0.8
SMF1P38925 YMR103CYMR103C 363 nt10.01□□□□□ -0.81
SMF1P38925 TRT2tT(CGU)K 72 nt10□□□□□ -0.81
SMF1P38925 YMR244WYMR244W 1068 nt10□□□□□ -0.81
SMF1P38925 PET8YNL003C 855 nt10□□□□□ -0.81
SMF1P38925 CCT2YIL142W 1584 nt10□□□□□ -0.81
SMF1P38925 OPI10YOL032W 741 nt9.99□□□□□ -0.81
SMF1P38925 ARO8YGL202W 1503 nt9.98□□□□□ -0.81
SMF1P38925 MEP3YPR138C 1470 nt9.98□□□□□ -0.81
SMF1P38925 COQ8YGL119W 1506 nt9.97□□□□□ -0.81
SMF1P38925 FMS1YMR020W 1527 nt9.97□□□□□ -0.81
SMF1P38925 ACH1YBL015W 1581 nt9.97□□□□□ -0.81
SMF1P38925 RBG1YAL036C 1110 nt9.97□□□□□ -0.81
SMF1P38925 GLR1YPL091W 1452 nt9.96□□□□□ -0.82
SMF1P38925 FLR1YBR008C 1647 nt9.96□□□□□ -0.82
SMF1P38925 LSB6YJL100W 1824 nt9.96□□□□□ -0.82
SMF1P38925 SPP2YOR148C 558 nt9.94□□□□□ -0.82
SMF1P38925 UGP1YKL035W 1500 nt9.93□□□□□ -0.82
SMF1P38925 UGA4YDL210W 1716 nt9.93□□□□□ -0.82
SMF1P38925 RSC8YFR037C 1674 nt9.93□□□□□ -0.82
SMF1P38925 BET2YPR176C 978 nt9.92□□□□□ -0.82
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