Protein–RNA interactions for Protein: P38349

UBX7, UBX domain-containing protein 7, yeastyeast

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX7P38349 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.85□□□□□ -0.67
UBX7P38349 PAM17YKR065C 594 nt10.84□□□□□ -0.67
UBX7P38349 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.83□□□□□ -0.68
UBX7P38349 CCA1YER168C 1641 nt10.82□□□□□ -0.68
UBX7P38349 SAM1YLR180W 1149 nt10.79□□□□□ -0.68
UBX7P38349 YLR111WYLR111W 333 nt10.78□□□□□ -0.68
UBX7P38349 SHH4YLR164W 507 nt10.77□□□□□ -0.69
UBX7P38349 TOM20YGR082W 552 nt10.76□□□□□ -0.69
UBX7P38349 RPL4BYDR012W 1089 nt10.75□□□□□ -0.69
UBX7P38349 RPL4AYBR031W 1089 nt10.75□□□□□ -0.69
UBX7P38349 RPM1RPM1 483 nt10.73□□□□□ -0.69
UBX7P38349 NBP35YGL091C 987 nt10.72□□□□□ -0.69
UBX7P38349 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.71□□□□□ -0.69
UBX7P38349 RPS14BYJL191W 417 nt10.71□□□□□ -0.69
UBX7P38349 SDH5YOL071W 489 nt10.71□□□□□ -0.69
UBX7P38349 YJL118WYJL118W 660 nt10.69□□□□□ -0.7
UBX7P38349 TOM6YOR045W 186 nt10.69□□□□□ -0.7
UBX7P38349 SWE1YJL187C 2460 nt10.69□□□□□ -0.7
UBX7P38349 TIR3YIL011W 810 nt10.68□□□□□ -0.7
UBX7P38349 CAB5YDR196C 726 nt10.65□□□□□ -0.7
UBX7P38349 RAD51YER095W 1203 nt10.65□□□□□ -0.7
UBX7P38349 PEX2YJL210W 816 nt10.65□□□□□ -0.7
UBX7P38349 ABZ2YMR289W 1125 nt10.65□□□□□ -0.7
UBX7P38349 RAD23YEL037C 1197 nt10.63□□□□□ -0.71
UBX7P38349 UTH1YKR042W 1098 nt10.63□□□□□ -0.71
UBX7P38349 POM34YLR018C 900 nt10.63□□□□□ -0.71
UBX7P38349 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.63□□□□□ -0.71
UBX7P38349 DUS1YML080W 1272 nt10.63□□□□□ -0.71
UBX7P38349 STR3YGL184C 1398 nt10.61□□□□□ -0.71
UBX7P38349 HIP1YGR191W 1812 nt10.61□□□□□ -0.71
UBX7P38349 COG1YGL223C 1254 nt10.6□□□□□ -0.71
UBX7P38349 AQY2YLL052C 450 nt10.6□□□□□ -0.71
UBX7P38349 PRO1YDR300C 1287 nt10.58□□□□□ -0.72
UBX7P38349 YGR012WYGR012W 1182 nt10.58□□□□□ -0.72
UBX7P38349 YPL041CYPL041C 624 nt10.57□□□□□ -0.72
UBX7P38349 TSC10YBR265W 963 nt10.57□□□□□ -0.72
UBX7P38349 NRT1YOR071C 1797 nt10.57□□□□□ -0.72
UBX7P38349 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.56□□□□□ -0.72
UBX7P38349 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.56□□□□□ -0.72
UBX7P38349 UME6YDR207C 2511 nt10.56□□□□□ -0.72
UBX7P38349 FTH1YBR207W 1398 nt10.54□□□□□ -0.72
UBX7P38349 RIB3YDR487C 627 nt10.54□□□□□ -0.72
UBX7P38349 YML089CYML089C 369 nt10.54□□□□□ -0.72
UBX7P38349 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.52□□□□□ -0.73
UBX7P38349 TIF6YPR016C 738 nt10.52□□□□□ -0.73
UBX7P38349 BUR6YER159C 429 nt10.51□□□□□ -0.73
UBX7P38349 LSC2YGR244C 1284 nt10.51□□□□□ -0.73
UBX7P38349 MET28YIR017C 564 nt10.5□□□□□ -0.73
UBX7P38349 ATG15YCR068W 1563 nt10.49□□□□□ -0.73
UBX7P38349 YLR279WYLR279W 390 nt10.49□□□□□ -0.73
UBX7P38349 STE4YOR212W 1272 nt10.49□□□□□ -0.73
UBX7P38349 YCL074WYCL074W 927 nt10.48□□□□□ -0.73
UBX7P38349 YNR029CYNR029C 1290 nt10.48□□□□□ -0.73
UBX7P38349 YLR349WYLR349W 507 nt10.47□□□□□ -0.73
UBX7P38349 MSB4YOL112W 1479 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX7P38349 FUN14YAL008W 597 nt10.43□□□□□ -0.74
UBX7P38349 ARP6YLR085C 1317 nt10.42□□□□□ -0.74
UBX7P38349 YJL195CYJL195C 702 nt10.42□□□□□ -0.74
UBX7P38349 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt10.42□□□□□ -0.74
UBX7P38349 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.4□□□□□ -0.74
UBX7P38349 RSC4YKR008W 1878 nt10.4□□□□□ -0.75
UBX7P38349 GAP1YKR039W 1809 nt10.38□□□□□ -0.75
UBX7P38349 ADH1YOL086C 1047 nt10.38□□□□□ -0.75
UBX7P38349 YTH1YPR107C 627 nt10.38□□□□□ -0.75
UBX7P38349 ADH7YCR105W 1086 nt10.37□□□□□ -0.75
UBX7P38349 FIT3YOR383C 615 nt10.37□□□□□ -0.75
UBX7P38349 PAU15YIR041W 375 nt10.36□□□□□ -0.75
UBX7P38349 SRN2YLR119W 642 nt10.36□□□□□ -0.75
UBX7P38349 YHM2YMR241W 945 nt10.34□□□□□ -0.75
UBX7P38349 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt10.33□□□□□ -0.76
UBX7P38349 PLB1YMR008C 1995 nt10.32□□□□□ -0.76
UBX7P38349 NAS6YGR232W 687 nt10.32□□□□□ -0.76
UBX7P38349 FUR4YBR021W 1902 nt10.31□□□□□ -0.76
UBX7P38349 YPI1YFR003C 468 nt10.31□□□□□ -0.76
UBX7P38349 LOT5YKL183W 921 nt10.31□□□□□ -0.76
UBX7P38349 RTN2YDL204W 1182 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX7P38349 AAC1YMR056C 930 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX7P38349 GPN2YOR262W 1044 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX7P38349 GND1YHR183W 1470 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX7P38349 FAF1YIL019W 1041 nt10.28□□□□□ -0.76
UBX7P38349 BMT5YIL096C 1011 nt10.28□□□□□ -0.76
UBX7P38349 ZTA1YBR046C 1005 nt10.27□□□□□ -0.77
UBX7P38349 PUS5YLR165C 765 nt10.26□□□□□ -0.77
UBX7P38349 HMT1YBR034C 1047 nt10.26□□□□□ -0.77
UBX7P38349 APT2YDR441C 546 nt10.25□□□□□ -0.77
UBX7P38349 DIF1YLR437C 402 nt10.25□□□□□ -0.77
UBX7P38349 YEL008WYEL008W 381 nt10.24□□□□□ -0.77
UBX7P38349 YAR028WYAR028W 705 nt10.23□□□□□ -0.77
UBX7P38349 MTG2YHR168W 1557 nt10.22□□□□□ -0.77
UBX7P38349 ALP1YNL270C 1722 nt10.22□□□□□ -0.77
UBX7P38349 FHN1YGR131W 525 nt10.22□□□□□ -0.77
UBX7P38349 BNS1YGR230W 414 nt10.22□□□□□ -0.77
UBX7P38349 AKR2YOR034C 2250 nt10.21□□□□□ -0.77
UBX7P38349 SMM1YNR015W 1155 nt10.21□□□□□ -0.77
UBX7P38349 UTR1YJR049C 1593 nt10.2□□□□□ -0.78
UBX7P38349 BOR1YNL275W 1731 nt10.2□□□□□ -0.78
UBX7P38349 CPD1YGR247W 720 nt10.19□□□□□ -0.78
UBX7P38349 ATG17YLR423C 1254 nt10.16□□□□□ -0.78
UBX7P38349 ESS1YJR017C 513 nt10.15□□□□□ -0.78
UBX7P38349 REC114YMR133W 1287 nt10.15□□□□□ -0.78
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